More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0907 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0907  Zn-finger, CHC2 type  100 
 
 		 1098 aa  2290    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1921  DNA primase-like  76.04 
 
 		 1103 aa  1744    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3790  DNA primase catalytic core  75.95 
 
 		 1103 aa  1744    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0772  DNA primase catalytic core domain protein  32.21 
 
 		 1026 aa  182  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0630  DNA primase catalytic core domain protein  31.95 
 
 		 1026 aa  181  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  25.6 
 
 		 595 aa  90.9  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1810  DNA primase  25.49 
 
 		 605 aa  90.1  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  25.13 
 
 		 614 aa  90.1  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  24.93 
 
 		 605 aa  86.3  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  25.8 
 
 		 599 aa  84.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  24.38 
 
 		 572 aa  81.3  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  26.59 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  24.86 
 
 		 595 aa  80.1  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  24.23 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  24.95 
 
 		 601 aa  77.4  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  23.9 
 
 		 598 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  27.35 
 
 		 576 aa  76.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  26.89 
 
 		 651 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  24.68 
 
 		 550 aa  76.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  26.11 
 
 		 587 aa  75.9  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  25.8 
 
 		 593 aa  75.1  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 604 aa  73.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  25.97 
 
 		 577 aa  73.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  26.82 
 
 		 601 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  25.37 
 
 		 535 aa  72.8  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  25.65 
 
 		 578 aa  73.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  25.95 
 
 		 655 aa  73.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  24.07 
 
 		 600 aa  73.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  26.91 
 
 		 652 aa  72.4  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  22.89 
 
 		 544 aa  72  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  30.15 
 
 		 638 aa  72  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3449  DNA primase  26.89 
 
 		 646 aa  72  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  28.81 
 
 		 599 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  30.07 
 
 		 679 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  23.31 
 
 		 554 aa  70.5  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  23.63 
 
 		 571 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  23.63 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  23.63 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  23.63 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  23.63 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  23.63 
 
 		 598 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0348  DNA primase  27.43 
 
 		 582 aa  69.7  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  23.63 
 
 		 598 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  26.12 
 
 		 583 aa  69.7  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  25.54 
 
 		 576 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  23.63 
 
 		 598 aa  69.3  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  27.95 
 
 		 660 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  27.22 
 
 		 651 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  23.63 
 
 		 598 aa  68.9  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  27.95 
 
 		 660 aa  68.9  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0840  DNA primase  27.25 
 
 		 654 aa  68.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  24.3 
 
 		 574 aa  68.6  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  27.63 
 
 		 675 aa  68.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  28.29 
 
 		 660 aa  68.2  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  23.62 
 
 		 617 aa  68.2  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  27.95 
 
 		 660 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  26.65 
 
 		 652 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  25.66 
 
 		 578 aa  67.8  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  24.86 
 
 		 573 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4073  DNA primase  26.04 
 
 		 646 aa  67.8  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302431 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0397  DNA primase  27.16 
 
 		 643 aa  67  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  24.93 
 
 		 575 aa  66.6  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  25.22 
 
 		 565 aa  66.6  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  24.7 
 
 		 595 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  23.82 
 
 		 574 aa  67.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  25.78 
 
 		 598 aa  67.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1917  zinc finger CHC2-family protein  25.9 
 
 		 1084 aa  67.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  23.25 
 
 		 574 aa  66.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  27.4 
 
 		 594 aa  66.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  26.67 
 
 		 626 aa  66.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  28.34 
 
 		 686 aa  66.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2050  DNA primase  26.65 
 
 		 643 aa  66.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.279269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  27.3 
 
 		 664 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  24.56 
 
 		 604 aa  65.9  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  24.55 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  26.14 
 
 		 552 aa  65.5  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0967  DNA primase  27.47 
 
 		 646 aa  65.5  0.000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0290559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  23.51 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2262  DNA primase  28.43 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.9199 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3034  DNA primase  26.7 
 
 		 619 aa  65.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.514313  normal  0.0365839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  27.46 
 
 		 640 aa  65.5  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  23.55 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  23.55 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  27.12 
 
 		 619 aa  65.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  27.08 
 
 		 663 aa  65.1  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  23.36 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  24.94 
 
 		 666 aa  64.7  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  24.4 
 
 		 595 aa  64.7  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  26.02 
 
 		 656 aa  63.9  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  28.32 
 
 		 684 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  25.67 
 
 		 669 aa  64.3  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1997  zinc finger CHC2-family protein  24.79 
 
 		 1086 aa  63.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  26.5 
 
 		 655 aa  63.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  26.76 
 
 		 663 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  24.1 
 
 		 576 aa  63.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  25.06 
 
 		 584 aa  63.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  25 
 
 		 575 aa  63.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0307  zinc finger CHC2-family protein  24.79 
 
 		 1086 aa  63.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.293874  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  28.01 
 
 		 682 aa  63.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0761  DNA primase  26.02 
 
 		 588 aa  63.2  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.573465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>