More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0906 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0906  ATP-dependent DNA helicase RecD/TraA  100 
 
 		 740 aa  1524    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.618422  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1922  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  79.05 
 
 		 698 aa  1174    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0245308  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3789  hypothetical protein  80.35 
 
 		 698 aa  1175    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0516841  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  34.09 
 
 		 727 aa  353  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  33.24 
 
 		 733 aa  346  7e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  32.31 
 
 		 744 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  33.24 
 
 		 733 aa  345  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  32.84 
 
 		 750 aa  341  4e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1753  helicase RecD/TraA  32.13 
 
 		 736 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.473009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  32.75 
 
 		 728 aa  339  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1757  helicase, RecD/TraA family  32.74 
 
 		 746 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  33.02 
 
 		 738 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0197  helicase, RecD/TraA family  34.01 
 
 		 724 aa  337  5e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959927  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2733  helicase, RecD/TraA family  31.36 
 
 		 762 aa  337  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0135188  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  31.41 
 
 		 739 aa  336  7.999999999999999e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6026  helicase, RecD/TraA family  32.49 
 
 		 742 aa  336  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0230  RecD/TraA family helicase  33.24 
 
 		 741 aa  335  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3839  helicase, RecD/TraA family  33.2 
 
 		 750 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0839164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  32.14 
 
 		 731 aa  333  6e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0269  RecD/TraA family helicase  32.39 
 
 		 742 aa  332  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  32.85 
 
 		 738 aa  331  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4247  RecD/TraA family helicase  31.77 
 
 		 736 aa  331  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4756  helicase, RecD/TraA family  32.78 
 
 		 735 aa  331  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00416284  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0993  helicase, RecD/TraA family  33.43 
 
 		 728 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  32.43 
 
 		 727 aa  330  6e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  32.67 
 
 		 731 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5748  helicase, RecD/TraA family  33.19 
 
 		 768 aa  329  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2348  RecD/TraA family helicase  32.39 
 
 		 722 aa  328  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1404  helicase, RecD/TraA family  32.56 
 
 		 728 aa  325  3e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1393  RecD/TraA family helicase  33.43 
 
 		 719 aa  324  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4487  Exodeoxyribonuclease V  31.44 
 
 		 738 aa  324  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0244  helicase, RecD/TraA family  33.72 
 
 		 728 aa  325  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6207  helicase, RecD/TraA family  32.65 
 
 		 725 aa  324  4e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2249  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  32.57 
 
 		 746 aa  324  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000721338  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2289  helicase, RecD/TraA family  32.9 
 
 		 749 aa  323  6e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00901153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2403  helicase, RecD/TraA family  29.55 
 
 		 747 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2841  helicase RecD/TraA  33.43 
 
 		 733 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1909  RecD/TraA family helicase  32.93 
 
 		 732 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564024  unclonable  0.000014529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4923  RecD/TraA family helicase  33.33 
 
 		 744 aa  321  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.478208  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  32.17 
 
 		 737 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2725  helicase RecD/TraA  31.94 
 
 		 731 aa  320  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0186  RecD/TraA family helicase  31.91 
 
 		 728 aa  320  6e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2820  helicase, RecD/TraA family  32.35 
 
 		 754 aa  319  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00387787  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1552  helicase RecD/TraA  32.33 
 
 		 739 aa  318  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.338597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0503  helicase, RecD/TraA family  32.61 
 
 		 715 aa  318  2e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  32.39 
 
 		 728 aa  318  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2673  RecD/TraA family helicase  32.8 
 
 		 736 aa  316  8e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  30.96 
 
 		 740 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2089  RecD/TraA family helicase  32.39 
 
 		 742 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.0798211 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2311  helicase, RecD/TraA family  31.56 
 
 		 726 aa  313  5.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0243  helicase RecD/TraA  31.1 
 
 		 749 aa  313  9e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357399  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  30.91 
 
 		 731 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3190  RecD/TraA family helicase  31.45 
 
 		 710 aa  310  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.56818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0213  helicase, RecD/TraA family  30.89 
 
 		 740 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629499  normal  0.0445082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2723  helicase, RecD/TraA family  32.82 
 
 		 724 aa  310  6.999999999999999e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0246  RecD/TraA family helicase  31.87 
 
 		 742 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0509  helicase, RecD/TraA family  33.43 
 
 		 728 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.156779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2143  RecD/TraA family helicase  32.15 
 
 		 744 aa  306  7e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3054  helicase, RecD/TraA family  32.4 
 
 		 726 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2433  RecD/TraA family helicase  31.44 
 
 		 744 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0818  RecD/TraA family helicase  33.24 
 
 		 688 aa  302  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.662153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1221  helicase, RecD/TraA family  32.25 
 
 		 731 aa  302  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0667  helicase, RecD/TraA family  30.86 
 
 		 728 aa  300  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0540027  normal  0.0105669 
 
 
-
 
NC_002620  TC0302  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  33.08 
 
 		 744 aa  297  6e-79  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3613  RecD/TraA family helicase  31.07 
 
 		 719 aa  293  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0722  putative helicase  29.99 
 
 		 778 aa  289  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4514  putative helicase  30.13 
 
 		 778 aa  289  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837139  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4527  putative helicase  30.25 
 
 		 778 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0134792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4126  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.25 
 
 		 778 aa  288  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.396274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4137  exodeoxyribonuclease V, alpha subunit  30.11 
 
 		 778 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4474  putative helicase  30.11 
 
 		 778 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000066137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4477  helicase, putative  29.89 
 
 		 778 aa  286  9e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.718062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2085  exodeoxyribonuclease V  30.52 
 
 		 732 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4622  helicase  30.25 
 
 		 770 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0758  helicase, RecD/TraA family  31.81 
 
 		 719 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4289  helicase  30.25 
 
 		 778 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0446  RecD/TraA family helicase  30.48 
 
 		 735 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000295111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4241  RecD/TraA family helicase  29.39 
 
 		 778 aa  283  9e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1742  exonuclease V subunit alpha  30.58 
 
 		 834 aa  281  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1724  helicase, putative  31.07 
 
 		 806 aa  280  5e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0956  helicase, RecD/TraA family  30.32 
 
 		 786 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0089  exonuclease V subunit alpha  29.13 
 
 		 813 aa  278  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3106  RecD/TraA family helicase  28.73 
 
 		 772 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2495  helicase, RecD/TraA family  28.96 
 
 		 784 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1047  helicase, RecD/TraA family  30.12 
 
 		 711 aa  267  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.604739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8706  helicase, RecD/TraA family  30.35 
 
 		 740 aa  266  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.671857  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2726  helicase, RecD/TraA family  30.69 
 
 		 741 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000501325  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_718  predicted protein  29.22 
 
 		 772 aa  258  4e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0625209  normal  0.543331 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1183  RecD/TraA family helicase  31.22 
 
 		 810 aa  257  6e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0696  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  30.51 
 
 		 795 aa  255  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3584  Exodeoxyribonuclease V  30.73 
 
 		 720 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.68504 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  31.53 
 
 		 726 aa  251  2e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1710  RecD/TraA family helicase  29.27 
 
 		 825 aa  246  8e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1676  RecD/TraA family helicase  29.27 
 
 		 825 aa  246  8e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1186  exonuclease V subunit alpha  30.81 
 
 		 792 aa  246  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000641615  normal  0.675634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3380  RecD/TraA family helicase  29.07 
 
 		 742 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586227 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1903  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  28.24 
 
 		 833 aa  236  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0608  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  27.34 
 
 		 825 aa  226  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2772  Exodeoxyribonuclease V  32.36 
 
 		 653 aa  226  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00547941  hitchhiker  0.000384136 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1106  ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase  29.24 
 
 		 766 aa  223  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.710549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>