More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0893 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0893  SOS-response transcriptional repressor, LexA  100 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  69.9 
 
 		 207 aa  298  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  70.39 
 
 		 207 aa  296  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2084  SOS-response transcriptional repressor, LexA  47.14 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0507519 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  44.9 
 
 		 222 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1873  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.81 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.164237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.07 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27590  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.81 
 
 		 235 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  44.67 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.18 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2134  SOS-response transcriptional repressor, LexA  43.15 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.017177 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1611  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.71 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000160494  unclonable  3.1983e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  41.01 
 
 		 238 aa  148  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1258  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.04 
 
 		 243 aa  147  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.16 
 
 		 215 aa  147  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07410  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.23 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000224442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  41.38 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  41.46 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  41.55 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  43.88 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  42.65 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.71 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  42.65 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  41.71 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  41.46 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  41.46 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  41.46 
 
 		 223 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  43.84 
 
 		 207 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  41.46 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  41.46 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  41.46 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  41.46 
 
 		 206 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1479  LexA repressor  38.33 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0381882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7132  Repressor lexA  39.62 
 
 		 236 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.53 
 
 		 231 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.15 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  41.46 
 
 		 269 aa  141  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2441  LexA repressor  38.89 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628301  normal  0.115914 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  41.46 
 
 		 269 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  42.79 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2221  LexA repressor  41.58 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0110096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2543  LexA family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0539699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  41.58 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3956  LexA repressor  38.79 
 
 		 232 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal  0.995266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1409  LexA family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0567372  decreased coverage  0.00000225039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3328  transcriptional repressor, LexA family  40.48 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.36 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  40.54 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  40.49 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2446  transcriptional repressor, LexA family  38.83 
 
 		 226 aa  138  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.575713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  40.18 
 
 		 230 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1451  LexA repressor  39.32 
 
 		 261 aa  138  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.440028  normal  0.764251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.7 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1583  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.81 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.4567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4562  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.81 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2157  LexA repressor  37.38 
 
 		 230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00513762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1504  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.03 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000188226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2168  LexA repressor  37.38 
 
 		 230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2214  LexA repressor  37.38 
 
 		 230 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  0.149598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  40.3 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4471  transcriptional repressor, LexA family  39.9 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  38.33 
 
 		 230 aa  134  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  42.13 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.2 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1434  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.6 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.298134  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17230  SOS-response transcriptional repressor, LexA  39.19 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.302677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1572  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.49 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  41.5 
 
 		 201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3902  transcriptional repressor, LexA family  38.5 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  40.1 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  39.02 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  38.35 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  38.35 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12734  LexA repressor  38.16 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.46 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0677  LexA repressor  40.8 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000451027  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2433  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.5 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.342507  normal  0.324912 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  39.29 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1470  LexA repressor  36.28 
 
 		 249 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000034906 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  38.78 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10620  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.79 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.445804  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3510  LexA repressor  36 
 
 		 256 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3979  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.92 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.712673  normal  0.0708135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23040  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.53 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.620289  normal  0.0692962 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1566  transcriptional repressor, LexA family  37.27 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000959525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1808  transcriptional repressor, LexA family  36.28 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1468  LexA repressor  37.78 
 
 		 288 aa  127  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.097089  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.31 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3817  LexA repressor  37.61 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.18019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1506  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.65 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.03098  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1814  SOS-response transcriptional repressor, LexA  37.81 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07330  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.23 
 
 		 238 aa  124  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.140562  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3565  LexA repressor  38.57 
 
 		 224 aa  124  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000173958  hitchhiker  0.00714221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1232  LexA repressor  34.86 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal  0.0166325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.92 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3074  Repressor lexA  41.38 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  38.89 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1179  LexA repressor  36.89 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865174  normal  0.239395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  36.59 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>