More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0881 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0881  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  862    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000177565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2052  glycosyl transferase group 1  47.54 
 
 		 412 aa  368  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000028188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0268  hypothetical protein  43.21 
 
 		 596 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  40.89 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0054  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 398 aa  216  9e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0374  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.74 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25140  glycosyltransferase  34.49 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11380  glycosyltransferase  38.35 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.54834  normal  0.650863 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.99 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  28.88 
 
 		 398 aa  87.4  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 		 360 aa  87.4  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  38.94 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  25.11 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  36.97 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  36.97 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.08 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  26.61 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  27.17 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  33.74 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3107  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  28.88 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0207  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1888  glycogen synthase  27.82 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000814984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  31.5 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2900  glycogen synthase  31.69 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  25.6 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3880  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  23.65 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  28.57 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1822  glycogen synthase  28.26 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.222954 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  30.86 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  29.67 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  34.39 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  23.81 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  33.56 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  29.62 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1174  glycogen synthase  28.74 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  34.39 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.99 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2112  glycogen synthase  31.8 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  26.12 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0202  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  29.62 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  33.99 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  36.44 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  32.16 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21730  glycogen synthase  26.14 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 371 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1119  glycogen synthase  33.48 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493813  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1501  glycosyl transferase, group 1  37.41 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  31.87 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  29.39 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  19.72 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  24.23 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  43.64 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2141  glycogen synthase  28.14 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309796  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  38.76 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>