97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0858 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  76.56 
 
 
307 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  73.44 
 
 
306 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  73.44 
 
 
307 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.2 
 
 
306 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.16 
 
 
307 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  70.98 
 
 
307 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.94 
 
 
309 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  71.09 
 
 
306 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  72.16 
 
 
305 aa  377  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  71.09 
 
 
306 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  71.09 
 
 
306 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  70.2 
 
 
306 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  70.31 
 
 
306 aa  374  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  70.2 
 
 
304 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  69.92 
 
 
307 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  69.92 
 
 
307 aa  370  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  70.31 
 
 
306 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  68.36 
 
 
303 aa  367  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  71.37 
 
 
305 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  71.37 
 
 
305 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  71.37 
 
 
305 aa  364  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  70.31 
 
 
305 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  70.59 
 
 
305 aa  362  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  70.59 
 
 
305 aa  362  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  63.92 
 
 
303 aa  355  5e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  69.53 
 
 
307 aa  348  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  68.63 
 
 
306 aa  346  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  63.67 
 
 
303 aa  344  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  62.6 
 
 
313 aa  343  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  66.67 
 
 
320 aa  338  7e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  66.67 
 
 
320 aa  338  7e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  66.67 
 
 
314 aa  334  9e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  65.59 
 
 
299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  64.29 
 
 
319 aa  318  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  45.34 
 
 
324 aa  215  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  43.75 
 
 
303 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  42.5 
 
 
337 aa  205  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  39.29 
 
 
303 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  43.53 
 
 
320 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  45.45 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.85 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  46.67 
 
 
318 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  42.6 
 
 
313 aa  190  2e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  43.75 
 
 
320 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.84 
 
 
277 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  46.41 
 
 
342 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  44.44 
 
 
324 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  41.26 
 
 
314 aa  180  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  40.18 
 
 
328 aa  178  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  41.33 
 
 
291 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  41.42 
 
 
322 aa  175  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  40.44 
 
 
291 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  40 
 
 
327 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.22 
 
 
330 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  39.64 
 
 
315 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  37.72 
 
 
323 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.35 
 
 
296 aa  161  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  37.72 
 
 
291 aa  160  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  40.27 
 
 
327 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  36.21 
 
 
291 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  38.63 
 
 
297 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  38.64 
 
 
291 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.94 
 
 
332 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  39.32 
 
 
294 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.05 
 
 
298 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  38.46 
 
 
294 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  37.07 
 
 
297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.78 
 
 
293 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  80.85 
 
 
130 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  23.98 
 
 
295 aa  53.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  27.78 
 
 
331 aa  53.5  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  25.09 
 
 
326 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  25.09 
 
 
326 aa  50.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.09 
 
 
326 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  27.81 
 
 
333 aa  50.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  23.95 
 
 
322 aa  49.7  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  28.25 
 
 
324 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  23.22 
 
 
333 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.95 
 
 
334 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  32.28 
 
 
351 aa  46.6  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.85 
 
 
325 aa  46.2  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1147  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.8 
 
 
302 aa  46.2  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.253731  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.17 
 
 
333 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  26.49 
 
 
326 aa  45.4  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2294  CRISPR-associated protein Cas1  32.26 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  24.6 
 
 
325 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  28.15 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.2 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0735  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.81 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0403946  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0772  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.52 
 
 
342 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.81 
 
 
325 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3218  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.19 
 
 
331 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000280385  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  25.6 
 
 
326 aa  42.7  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  29.52 
 
 
339 aa  42.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.81 
 
 
325 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15210  CRISPR-associated protein Cas1  31.18 
 
 
325 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>