18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0854 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0854  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  268  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1342  hypothetical protein  47.33 
 
 
238 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0167  hypothetical protein  46.81 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0166  hypothetical protein  39.53 
 
 
173 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02621  conserved hypothetical protein  40.44 
 
 
282 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3082  hypothetical protein  38.93 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000103876  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1370  hypothetical protein  37.27 
 
 
134 aa  60.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.103597  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2880  hypothetical protein  46.34 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2916  hypothetical protein  40.91 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144529  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1373  hypothetical protein  36.36 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00827993  normal  0.860871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1253  hypothetical protein  37.74 
 
 
443 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1252  hypothetical protein  36.89 
 
 
194 aa  50.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1366  hypothetical protein  36.08 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0265847  normal  0.87612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00875  hypothetical protein  42.37 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1369  hypothetical protein  36.08 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0323881  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3247  hypothetical protein  50 
 
 
51 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.235379  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1367  hypothetical protein  39.13 
 
 
181 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0285894  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00874  hypothetical protein  44.23 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>