More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0825 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  719    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  48.39 
 
 
353 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  53.65 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  40.82 
 
 
345 aa  202  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  42.3 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 
414 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 
335 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  33.9 
 
 
335 aa  99.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7064  hypothetical protein  32.05 
 
 
340 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  33.89 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  30.07 
 
 
395 aa  90.9  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.92 
 
 
471 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.88 
 
 
505 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  31.99 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2865  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.92 
 
 
478 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0716848 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  33.07 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  33.61 
 
 
344 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.8 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  33.47 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  28.33 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  28.06 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  29.84 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  34.19 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 
500 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  26.78 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  24.93 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1793  hypothetical protein  30.42 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0463341  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  34.63 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1596  secretion protein HlyD family protein  29.66 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0836964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  29.54 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  27.21 
 
 
339 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  24.81 
 
 
439 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  33.33 
 
 
479 aa  76.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  29.39 
 
 
326 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  28.62 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  27.64 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  30.8 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.25 
 
 
448 aa  73.6  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  25.96 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  26.49 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 
496 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  27.72 
 
 
400 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  25.68 
 
 
399 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3537  hypothetical protein  31.82 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  32 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  30.92 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  27.85 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.59 
 
 
496 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  25.92 
 
 
517 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  29.31 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  30.14 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.71 
 
 
504 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2861  secretion protein, HlyD family  28.57 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  25.22 
 
 
400 aa  69.3  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 
426 aa  69.3  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2482  secretion protein HlyD family protein  28.57 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.79 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  27.38 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.33 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  25.96 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  29.61 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  24.01 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  27.04 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.98 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  30.11 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3705  hypothetical protein  31.36 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  22.74 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  23.97 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 
465 aa  67  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  31.38 
 
 
333 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.74 
 
 
421 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1305  hypothetical protein  34.82 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.126611  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  31.93 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  27.62 
 
 
353 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  27.38 
 
 
449 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.62 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  27.76 
 
 
424 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 
453 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.59 
 
 
467 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.69 
 
 
428 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.97 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.34 
 
 
421 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1295  secretion protein HlyD family protein  28.22 
 
 
361 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  28.39 
 
 
375 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  30.29 
 
 
430 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  25.09 
 
 
429 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2645  hypothetical protein  26.92 
 
 
310 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1666  RND family efflux transporter MFP subunit  25.39 
 
 
418 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.9 
 
 
432 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  28.88 
 
 
372 aa  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.74 
 
 
469 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  24.58 
 
 
607 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
411 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  26.71 
 
 
361 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.35 
 
 
419 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1628  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.97 
 
 
383 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  27.18 
 
 
509 aa  62.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0694634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>