55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0759 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  100 
 
 		 429 aa  890    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  59.85 
 
 		 403 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  61.97 
 
 		 439 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  60.2 
 
 		 409 aa  498  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1199  putative ABC transporter solute-binding protein  58.73 
 
 		 430 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.134978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4231  putative ABC transporter solute-binding protein  43 
 
 		 410 aa  318  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3278  putative ABC transporter solute-binding protein  43.46 
 
 		 408 aa  297  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  38.37 
 
 		 409 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4046  putative ABC transporter solute-binding protein  41.99 
 
 		 406 aa  285  9e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0200  putative ABC transporter solute-binding protein  40.94 
 
 		 401 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1832  putative ABC transporter solute-binding protein  40.75 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563171 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1446  putative ABC transporter solute-binding protein  41.02 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  39.63 
 
 		 401 aa  276  7e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1236  hypothetical protein  37.78 
 
 		 429 aa  260  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2251  putative ABC transporter solute-binding protein  37.16 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1693  putative ABC transporter solute-binding protein  37.67 
 
 		 390 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2068  putative ABC transporter solute-binding protein  35.28 
 
 		 424 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0976  putative ABC transporter solute-binding protein  33.65 
 
 		 435 aa  229  9e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0361  putative ABC transporter solute-binding protein  34.99 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.083844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1269  putative ABC transporter solute-binding protein  35.67 
 
 		 382 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000820878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2153  extracellular solute-binding protein  33.95 
 
 		 404 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000427732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2959  putative ABC transporter solute-binding protein  33.07 
 
 		 419 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1977  putative ABC transporter solute-binding protein  36.44 
 
 		 388 aa  219  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01711  hypothetical protein  37.6 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01723  hypothetical protein  37.6 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1888  extracellular solute-binding protein family 1  37.6 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00824785  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1838  putative ABC transporter solute-binding protein  37.6 
 
 		 388 aa  219  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1878  putative ABC transporter solute-binding protein  37.6 
 
 		 388 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418187 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01789  putative ABC-type transport system, periplasmic component  35.71 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2473  putative ABC transporter solute-binding protein  36.1 
 
 		 388 aa  216  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003793  ABC transporter substrate-binding protein YnjB  32.95 
 
 		 386 aa  216  8e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000277117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1436  putative ABC transporter solute-binding protein  35.83 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.463512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2003  putative ABC transporter solute-binding protein  35.9 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02678  putative ABC transporter solute-binding protein  34.14 
 
 		 403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2768  putative ABC transporter solute-binding protein  33.85 
 
 		 381 aa  211  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.211813  normal  0.195627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0393  putative ABC transporter solute-binding protein  29.58 
 
 		 373 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.235452  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 380 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  25.98 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  26.44 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1874  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2181  ABC transporter substrate binding protein  23.16 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2094  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  22.67 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 377 aa  57  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0518  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  21.64 
 
 		 385 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0180  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0182  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 382 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.455804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5538  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  22.34 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1656  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 388 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.432631  normal  0.449187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  23.86 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4218  spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  48.57 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6719  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.08 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0109692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1684  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 388 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1205  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 388 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4845  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.74 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0226871  decreased coverage  0.000145502 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3397  ABC opine/polyamine transporter, periplasmic binding protein  21.53 
 
 		 347 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>