More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0620 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  585  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0137294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1491  integrase family protein  43.57 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10711  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  40.22 
 
 		 371 aa  188  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000586623  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1687  integrase family protein  40.3 
 
 		 355 aa  175  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2734  integrase family protein  28.07 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000151395  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2906  integrase family protein  27.27 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0825768  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  26.34 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  33.33 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  29.25 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.66 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.75 
 
 		 359 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  32.85 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  30.71 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  27.9 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  27.88 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  30.81 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  31.16 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  24.29 
 
 		 406 aa  59.3  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  29.2 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  34.07 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  32.86 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  32.06 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  24.89 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  29.24 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  31.69 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.65 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  24.46 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  32.61 
 
 		 400 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1185  integrase family protein  24.88 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  24.15 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0222  integrase family protein  27.59 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.15 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.15 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.71 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  23.21 
 
 		 387 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  26.49 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.15 
 
 		 299 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  30 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.15 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  27.27 
 
 		 405 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.15 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  28.15 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.81 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  27.89 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  29.56 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.29 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.65 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.29 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4219  phage integrase family protein  24.72 
 
 		 463 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  24.29 
 
 		 393 aa  53.5  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.19 
 
 		 388 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  31.69 
 
 		 400 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  32.35 
 
 		 172 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  31.69 
 
 		 400 aa  53.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.65 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  29.6 
 
 		 346 aa  52.8  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  25.22 
 
 		 391 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  25.5 
 
 		 377 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.88 
 
 		 379 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  25.36 
 
 		 356 aa  52.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 401 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.03 
 
 		 296 aa  52.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  30.88 
 
 		 159 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0989  integrase family protein  24.53 
 
 		 355 aa  52.8  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000138199  hitchhiker  0.00000000000000368709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  21.88 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  29.93 
 
 		 354 aa  52.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.88 
 
 		 355 aa  52.4  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  25.15 
 
 		 353 aa  52.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  30 
 
 		 467 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  24.28 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  23.78 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  27.54 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.7 
 
 		 389 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  28.57 
 
 		 421 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  28.57 
 
 		 391 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 356 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  28 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  28.86 
 
 		 400 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  24.36 
 
 		 396 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  26.03 
 
 		 292 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  23.81 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  25.18 
 
 		 482 aa  50.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3006  integron integrase  25.62 
 
 		 334 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.976928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  25.47 
 
 		 393 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.26 
 
 		 317 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 342 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  27.38 
 
 		 429 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  26.81 
 
 		 404 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.18 
 
 		 365 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  24.56 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 419 aa  49.3  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  28.41 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  26.97 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  25.93 
 
 		 409 aa  49.3  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  24.85 
 
 		 383 aa  49.3  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.75 
 
 		 294 aa  48.9  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  23.12 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  26.95 
 
 		 408 aa  49.3  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>