More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0530 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  55.75 
 
 
305 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.59 
 
 
292 aa  299  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  53.82 
 
 
289 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.52 
 
 
292 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.87 
 
 
325 aa  259  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  40.86 
 
 
325 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  41.18 
 
 
315 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  43.34 
 
 
311 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  42.18 
 
 
310 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  41.84 
 
 
310 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  42.71 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  39.36 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  40.07 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  39.73 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  30.42 
 
 
309 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  30.42 
 
 
309 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  30.04 
 
 
309 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  29.86 
 
 
311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.17 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  31.51 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  32.22 
 
 
302 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 
309 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  31.48 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  31.48 
 
 
303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  31.11 
 
 
303 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  30.51 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  30.51 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  30.51 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  30.51 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  30.51 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  30.51 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  29.04 
 
 
303 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  33.57 
 
 
293 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
291 aa  122  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  30.5 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  30.94 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  29.25 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  27.47 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.51 
 
 
286 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  32.08 
 
 
309 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  31.67 
 
 
308 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.66 
 
 
286 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 
286 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  30.99 
 
 
219 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  29.89 
 
 
331 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  29.89 
 
 
311 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.37 
 
 
299 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  29.33 
 
 
305 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  31.87 
 
 
287 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  30.07 
 
 
294 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 
301 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  28.47 
 
 
286 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  28.92 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  28.77 
 
 
322 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  26.55 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 
310 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  30.34 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.93 
 
 
310 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  28.01 
 
 
310 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  30.9 
 
 
301 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  27.66 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  28.46 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  30.48 
 
 
319 aa  95.1  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  28.08 
 
 
300 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  31.36 
 
 
310 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  26.39 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  32.87 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  27.66 
 
 
310 aa  93.2  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  27.14 
 
 
310 aa  92.4  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 
330 aa  92.4  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  28.09 
 
 
294 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 
299 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.22 
 
 
299 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 
317 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 
309 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  27.87 
 
 
345 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  29.02 
 
 
306 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.03 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 
305 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.15 
 
 
301 aa  89.4  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 
305 aa  89  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  26.43 
 
 
309 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  29.73 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  25.35 
 
 
294 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  26.04 
 
 
294 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.32 
 
 
303 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
298 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 
287 aa  86.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  31.45 
 
 
317 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.61 
 
 
303 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  22.97 
 
 
303 aa  85.9  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.97 
 
 
303 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>