194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0342 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  100 
 
 		 220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  57.56 
 
 		 213 aa  241  5e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  59.82 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  59.33 
 
 		 213 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  53.47 
 
 		 230 aa  209  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  44.12 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.09 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.56 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  43.28 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.9 
 
 		 213 aa  164  9e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  44.44 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.36 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  42.29 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  42.29 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.76 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.44 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  42.99 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  45.37 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  41.94 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  40.55 
 
 		 218 aa  157  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  44.6 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  46.27 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.13 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.39 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  43.6 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  43.13 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.29 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  43.93 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  43.93 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.11 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.54 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  46.53 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  43.56 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.4 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.66 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.87 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.58 
 
 		 214 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.41 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  39.51 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  40.67 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  43.88 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  44.95 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  44.95 
 
 		 208 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  44.62 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  39.9 
 
 		 207 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  44.44 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  42.13 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  39.51 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  44.39 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  42.08 
 
 		 221 aa  134  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.63 
 
 		 541 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  44.44 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  34.67 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  44.93 
 
 		 499 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  39.02 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  41.23 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  42.93 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  38.83 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  43.78 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  42.93 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  41.41 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  43.37 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  36.32 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  41.92 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  41.33 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  43.09 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  42.86 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  41.03 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  42.93 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  40.82 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  40.59 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  38.95 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  44.16 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  41.58 
 
 		 512 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  42.86 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  44.67 
 
 		 211 aa  122  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  36.19 
 
 		 534 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  39.39 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  43.37 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  42.57 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  39.39 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  40.64 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  39.8 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  43.56 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  40.82 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.7 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2355  precorrin-8X methylmutase  37.17 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000155393  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2209  cobalt-precorrin-8X methylmutase  44.06 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2368  cobalt-precorrin-8X methylmutase  44.06 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  43.15 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  41.4 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  37.81 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2255  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.56 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.463985 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2202  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.56 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2155  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.56 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  39.8 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  40.2 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5691  Precorrin-8X methylmutase  40.86 
 
 		 210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>