More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0301 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  621  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.44 
 
 
320 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  61.86 
 
 
300 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  51.25 
 
 
301 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51 
 
 
330 aa  265  5e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  49.48 
 
 
301 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  49.32 
 
 
301 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.1 
 
 
301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  42.65 
 
 
296 aa  231  9e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.61 
 
 
303 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.72 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  40.29 
 
 
330 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  38.85 
 
 
317 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.2 
 
 
355 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  39.86 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 
315 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.08 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  31.23 
 
 
313 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  28.37 
 
 
309 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
305 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.18 
 
 
312 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 
283 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  29.29 
 
 
296 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  28.67 
 
 
307 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.69 
 
 
299 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  23.92 
 
 
310 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  28.37 
 
 
305 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  26.85 
 
 
305 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  28.72 
 
 
296 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 
305 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  26.99 
 
 
309 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  28.57 
 
 
291 aa  100  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  28.91 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.99 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  25.35 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.51 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.02 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 
315 aa  96.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  24.74 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.09 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  29.33 
 
 
302 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.06 
 
 
304 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  24.37 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  26.8 
 
 
311 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  28.67 
 
 
312 aa  92.8  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
304 aa  92  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  28.25 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 
303 aa  90.9  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  29.41 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  28.76 
 
 
297 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1447  hypothetical protein  26.87 
 
 
304 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000141757  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  27.93 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  29.24 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.64 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  27.73 
 
 
293 aa  87  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  25.57 
 
 
305 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  25.09 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  26.12 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  27.66 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  29.24 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  29.24 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  27.21 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  29.59 
 
 
311 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  27.96 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  31.46 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  25.61 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.84 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.41 
 
 
335 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  30.37 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  29.72 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  27.02 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  28.39 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  27.97 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  30 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  25.94 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  30.03 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  29.54 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.58 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  31.51 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  28.19 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  27.89 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  28.22 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  25.94 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  26.34 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  29.11 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 
312 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  26.89 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.44 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  29.05 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>