More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0295 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  75.87 
 
 		 432 aa  686    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 431 aa  879    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0451  phosphopyruvate hydratase  74.64 
 
 		 432 aa  640    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  73.71 
 
 		 430 aa  667    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  85.88 
 
 		 434 aa  765    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  86.18 
 
 		 437 aa  775    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  68.1 
 
 		 429 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  67.78 
 
 		 427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  67.46 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 429 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 428 aa  571  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  67.7 
 
 		 430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  67.86 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  67.38 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  68.52 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  66.19 
 
 		 428 aa  565  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  67.14 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  65.19 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  65.16 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  64.68 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  65.03 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  64.72 
 
 		 427 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 422 aa  563  1.0000000000000001e-159  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  66.11 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  68.81 
 
 		 426 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  65.27 
 
 		 428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 431 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  67.78 
 
 		 428 aa  559  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  65.39 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 431 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 431 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  65.63 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  65.63 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  67.54 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  64.34 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  66.59 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  64.92 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 425 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  65.63 
 
 		 430 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  63.96 
 
 		 426 aa  551  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  64.68 
 
 		 425 aa  552  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  65.73 
 
 		 426 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  62.76 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 		 431 aa  549  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  65.39 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  64.45 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  64.78 
 
 		 430 aa  548  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  63.98 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  66.11 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  63.82 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  64.41 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2015  enolase  64.49 
 
 		 427 aa  548  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000117332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  66.43 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  65.63 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  64.92 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  64.2 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  63.9 
 
 		 430 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2762  phosphopyruvate hydratase  64.92 
 
 		 426 aa  545  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  63.96 
 
 		 427 aa  548  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  64.49 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  63.74 
 
 		 431 aa  545  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0339  phosphopyruvate hydratase  66.91 
 
 		 426 aa  546  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2195  enolase  62.32 
 
 		 426 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000497652 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  63.72 
 
 		 425 aa  544  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  63.93 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  65.48 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  64.85 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  65.63 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  64.92 
 
 		 429 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  64.68 
 
 		 429 aa  541  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  63.25 
 
 		 426 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1743  phosphopyruvate hydratase  65.87 
 
 		 427 aa  541  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  64.37 
 
 		 429 aa  541  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  64.68 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1036  phosphopyruvate hydratase  65.25 
 
 		 431 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>