137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0270 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  33.83 
 
 
1739 aa  782    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  34.29 
 
 
1808 aa  708    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  34 
 
 
1839 aa  785    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  100 
 
 
1744 aa  3524    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  33.89 
 
 
1759 aa  723    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  33.02 
 
 
1823 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  32.84 
 
 
1737 aa  750    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  33 
 
 
1803 aa  688    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  33.86 
 
 
1737 aa  770    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  32.44 
 
 
1737 aa  757    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  33.58 
 
 
1738 aa  764    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  32.94 
 
 
1737 aa  771    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  34.12 
 
 
1815 aa  693    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  33 
 
 
1835 aa  761    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  33.79 
 
 
1805 aa  783    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1159  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  34.27 
 
 
1621 aa  725    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376607  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  34.41 
 
 
1808 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  35.86 
 
 
1772 aa  796    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  34.35 
 
 
1808 aa  695    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  34.01 
 
 
1743 aa  780    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  36.23 
 
 
1768 aa  818    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  34.94 
 
 
1832 aa  843    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.39 
 
 
1782 aa  756    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  35.34 
 
 
1758 aa  799    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  36.15 
 
 
1772 aa  799    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  32.07 
 
 
1682 aa  670    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35 
 
 
1768 aa  775    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.5 
 
 
1765 aa  803    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  33.5 
 
 
1824 aa  754    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.1 
 
 
1833 aa  608  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2253  hypothetical protein  29.64 
 
 
1569 aa  561  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1900  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.09 
 
 
1828 aa  562  1e-158  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4845  lipoprotein, putative  28.91 
 
 
1649 aa  503  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566822  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.34 
 
 
1664 aa  502  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.45 
 
 
1635 aa  498  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.12 
 
 
1632 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  28.49 
 
 
1652 aa  489  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.99 
 
 
1633 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  27.88 
 
 
1637 aa  485  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.23 
 
 
1633 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.22 
 
 
1823 aa  482  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29 
 
 
1633 aa  483  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  28.26 
 
 
1727 aa  477  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.53 
 
 
1650 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.55 
 
 
1663 aa  466  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  27.76 
 
 
1641 aa  455  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.69 
 
 
1641 aa  456  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.83 
 
 
1653 aa  452  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.74 
 
 
1652 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.77 
 
 
1653 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.49 
 
 
1653 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.77 
 
 
1653 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.49 
 
 
1653 aa  446  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  26.6 
 
 
1646 aa  446  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  27.36 
 
 
1653 aa  443  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.58 
 
 
1653 aa  443  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  26.52 
 
 
1644 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  26.52 
 
 
1644 aa  443  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  27.36 
 
 
1653 aa  443  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  26.52 
 
 
1644 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  26.18 
 
 
1665 aa  422  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.41 
 
 
1697 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  26.04 
 
 
1807 aa  385  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.22 
 
 
1619 aa  369  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.91 
 
 
1785 aa  353  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.42 
 
 
1859 aa  336  3e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.52 
 
 
1819 aa  331  8e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0163  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.13 
 
 
1864 aa  291  7e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2191  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.48 
 
 
1854 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466531  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1501  alpha-2-macroglobulin family N-terminal region domain protein  20.88 
 
 
1761 aa  270  1e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1529  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.21 
 
 
1895 aa  262  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.753642  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1028  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.49 
 
 
1824 aa  249  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  22.58 
 
 
1834 aa  245  3.9999999999999997e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.35 
 
 
1872 aa  238  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.35 
 
 
1872 aa  236  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  24.74 
 
 
1925 aa  235  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.2 
 
 
1872 aa  232  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  24.19 
 
 
1898 aa  230  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  23.56 
 
 
1921 aa  217  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  23.72 
 
 
1921 aa  216  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  25.79 
 
 
2002 aa  216  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.81 
 
 
2000 aa  215  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  25.85 
 
 
2000 aa  209  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.85 
 
 
2000 aa  209  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.05 
 
 
1992 aa  206  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.05 
 
 
1992 aa  206  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.95 
 
 
1998 aa  204  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.61 
 
 
1821 aa  192  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.63 
 
 
1916 aa  176  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.15 
 
 
1872 aa  169  5e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  24.92 
 
 
1974 aa  145  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.4 
 
 
2002 aa  138  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.67 
 
 
1971 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.76 
 
 
1971 aa  137  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.03 
 
 
2002 aa  135  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.13 
 
 
2195 aa  134  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1253  alpha-2-macroglobulin family protein  20.17 
 
 
1707 aa  133  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.07 
 
 
2191 aa  132  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.32 
 
 
1897 aa  113  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.15 
 
 
1704 aa  113  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>