142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0252 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  283  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  66.43 
 
 		 146 aa  166  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  59.54 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  45.89 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  43.54 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  44.74 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  47.73 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  40.54 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  45.07 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  45.07 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  42.96 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  37.84 
 
 		 172 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  33.11 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  39.71 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  39.86 
 
 		 148 aa  92  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  41.73 
 
 		 184 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  42.36 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  39.19 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  41.73 
 
 		 170 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  42.75 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  37.96 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  34.69 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  38.98 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  38.03 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  41.01 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0262  protein of unknown function DUF606  38.06 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  38.89 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  40.74 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  40.32 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2226  protein of unknown function DUF606  41.13 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  37.09 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  39.72 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  36.88 
 
 		 318 aa  80.5  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  37.3 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  35.25 
 
 		 174 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  35.56 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0608  hypothetical protein  40.14 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  38.57 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  38.76 
 
 		 163 aa  76.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  29.05 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  34.48 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  36.89 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5229  hypothetical protein  39.73 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274596  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3312  hypothetical protein  39.73 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5055  hypothetical protein  39.73 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  36.62 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0176  hypothetical protein  39.86 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  33.58 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  37.67 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  32.59 
 
 		 309 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  32.59 
 
 		 309 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  36.36 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  36.3 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  33.86 
 
 		 317 aa  71.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  36.73 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  36.43 
 
 		 146 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  32.85 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  33.1 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  35.66 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4917  hypothetical protein  40.41 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  30.14 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  37.06 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  35.17 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  32.03 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  32.89 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  34.48 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  35.04 
 
 		 307 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  32.39 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  34.81 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  32.82 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  31.58 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  31.29 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  36.29 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  34.01 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  57  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  44.16 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  35.11 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  29.93 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4288  protein of unknown function DUF606  31.11 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3463  hypothetical protein  29.52 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0977859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  28.29 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  27.4 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  31.78 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  29.58 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1296  hypothetical protein  34.93 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3996  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.01 
 
 		 163 aa  50.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.318499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  37.66 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  35.06 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  44.26 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  33.33 
 
 		 333 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  25.83 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  29.91 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  29.91 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>