232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0208 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1129    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  60.65 
 
 		 571 aa  691    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  61.01 
 
 		 571 aa  694    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  55.95 
 
 		 567 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  56.11 
 
 		 567 aa  596  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  54.06 
 
 		 570 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  55.56 
 
 		 557 aa  555  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  51.44 
 
 		 577 aa  550  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  51.44 
 
 		 577 aa  548  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  51.62 
 
 		 577 aa  548  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  46.62 
 
 		 587 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  47.49 
 
 		 521 aa  445  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  42.8 
 
 		 510 aa  402  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  43.05 
 
 		 629 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  37.94 
 
 		 515 aa  349  7e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  41.19 
 
 		 517 aa  347  5e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  39.89 
 
 		 638 aa  340  5e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  36.72 
 
 		 556 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  35.14 
 
 		 564 aa  322  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  36.98 
 
 		 541 aa  312  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  35.54 
 
 		 561 aa  303  7.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  38.45 
 
 		 520 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  36.4 
 
 		 574 aa  300  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  34.44 
 
 		 513 aa  296  8e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.45 
 
 		 550 aa  292  1e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  37.57 
 
 		 507 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  35.1 
 
 		 504 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  35.62 
 
 		 532 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  35.65 
 
 		 525 aa  283  6.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  37.81 
 
 		 524 aa  282  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  35.3 
 
 		 528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  36.29 
 
 		 518 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  36.44 
 
 		 524 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.74 
 
 		 560 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  36.61 
 
 		 526 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  36.03 
 
 		 515 aa  270  4e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  36.35 
 
 		 528 aa  270  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  36.98 
 
 		 521 aa  270  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  37.28 
 
 		 525 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  37.09 
 
 		 525 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  36.76 
 
 		 533 aa  266  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  36.9 
 
 		 533 aa  266  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  35.95 
 
 		 522 aa  264  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  35.09 
 
 		 533 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  36.61 
 
 		 522 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  35.69 
 
 		 522 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  36.61 
 
 		 522 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  36.76 
 
 		 529 aa  260  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  35.99 
 
 		 521 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  36.4 
 
 		 533 aa  259  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  31.65 
 
 		 779 aa  257  4e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  35.32 
 
 		 476 aa  257  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  34.18 
 
 		 527 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  34.99 
 
 		 520 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  35.17 
 
 		 522 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  35.17 
 
 		 522 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  35.17 
 
 		 522 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  34.36 
 
 		 522 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  34.77 
 
 		 526 aa  243  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.79 
 
 		 594 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  34.12 
 
 		 552 aa  240  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  35 
 
 		 521 aa  240  5.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  33.63 
 
 		 534 aa  234  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  35.9 
 
 		 546 aa  224  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  29.64 
 
 		 451 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  30.04 
 
 		 457 aa  206  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  30.35 
 
 		 493 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  29.9 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  29.74 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  29.74 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  29.74 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  29.74 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  29.74 
 
 		 460 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3255  Na+/H+ antiporter NhaC  31.4 
 
 		 574 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.208883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  28.99 
 
 		 460 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  28.89 
 
 		 454 aa  196  9e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  30.02 
 
 		 460 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  27.94 
 
 		 459 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  28.54 
 
 		 448 aa  190  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  28.71 
 
 		 460 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  30.12 
 
 		 393 aa  186  7e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  29.31 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  28.66 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  28.66 
 
 		 460 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  29.54 
 
 		 460 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2662  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  25.15 
 
 		 501 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  27.86 
 
 		 460 aa  179  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  30.67 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  29.65 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01078  Na+/H+ antiporter  40 
 
 		 318 aa  166  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  27.48 
 
 		 497 aa  160  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  27.27 
 
 		 497 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  27.27 
 
 		 497 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  29.13 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  27.48 
 
 		 497 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  26.9 
 
 		 507 aa  158  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  26.45 
 
 		 501 aa  158  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  26.23 
 
 		 497 aa  157  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  26.64 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01080  Na+/H+ antiporter  49.4 
 
 		 201 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>