195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0187 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  100 
 
 		 190 aa  391  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  72.49 
 
 		 190 aa  287  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  61.58 
 
 		 190 aa  259  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.57 
 
 		 192 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.26 
 
 		 190 aa  236  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  57.98 
 
 		 188 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  58.51 
 
 		 194 aa  231  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  58.6 
 
 		 188 aa  229  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.56 
 
 		 189 aa  230  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  55.85 
 
 		 189 aa  226  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  54.79 
 
 		 189 aa  224  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  54.79 
 
 		 189 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  56.08 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  53.72 
 
 		 189 aa  221  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  54.5 
 
 		 191 aa  220  9e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  53.72 
 
 		 200 aa  218  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.58 
 
 		 190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  52.63 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.68 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  41.27 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  35.94 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  33.52 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  34.95 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  35.79 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.77 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.93 
 
 		 186 aa  115  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  36.51 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  33.69 
 
 		 200 aa  111  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  36.05 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  30.32 
 
 		 185 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.11 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  30.56 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  35.23 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.52 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  29.44 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  29.44 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  33.73 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.84 
 
 		 186 aa  94.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  26.49 
 
 		 194 aa  88.6  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.71 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.73 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  28.47 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.21 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.66 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.92 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  35.85 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.37 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  29.55 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  29.37 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  21.21 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  26 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  25.93 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  29.01 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.93 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  27.41 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  30.53 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2037  hypothetical protein  27.52 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.902665  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.55 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.46 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  28.4 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1230  flavin reductase domain-containing protein  27.11 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.407466  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.13 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  33.05 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  33.05 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  33.05 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  28 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  33.05 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  33.05 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.09 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  24.86 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.2 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  25.15 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.62 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  27.88 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.17 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  25.19 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1553  hypothetical protein  24.06 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  29.45 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  27.48 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  31.9 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  30.4 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  26.04 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.52 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  25.19 
 
 		 185 aa  51.2  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  26.56 
 
 		 177 aa  51.2  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  30.13 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20750  conserved protein of DIM6/NTAB family  29.36 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7867  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.86 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358358 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.63 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.63 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0986  flavin reductase domain-containing protein  24.46 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.354559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.12 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  26.83 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  25.75 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  23.7 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.17 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>