More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0163 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  52.67 
 
 		 288 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  53.72 
 
 		 267 aa  271  9e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  48.64 
 
 		 276 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  35.09 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  40.34 
 
 		 671 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  40.34 
 
 		 671 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  40.34 
 
 		 671 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  41.06 
 
 		 876 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 335 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 339 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  34.09 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  37.06 
 
 		 664 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  34.64 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  34.64 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  34.5 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  34.52 
 
 		 616 aa  95.5  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  35 
 
 		 600 aa  92.4  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 		 249 aa  92.4  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  33.74 
 
 		 173 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  37.5 
 
 		 624 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.83 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 196 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  27.73 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  26.78 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  36.3 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  36.55 
 
 		 629 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  29.62 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  29.62 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  28.11 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  28.11 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  33.72 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  32.45 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  32.52 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  32.76 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  31.1 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  27.83 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  29.8 
 
 		 553 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  34.94 
 
 		 652 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  26.69 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  32.7 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  30.13 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  26.69 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.86 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  33.1 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  26.05 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  29.94 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  26.52 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  26.52 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 		 263 aa  72  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 		 210 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 		 222 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0098  protein-disulfide isomerase-like protein  30.11 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000192012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  35.71 
 
 		 652 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  33.79 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>