More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0152 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 572 aa  1166    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  72.73 
 
 		 531 aa  795    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.81 
 
 		 532 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.54 
 
 		 550 aa  670    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.55 
 
 		 527 aa  656    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.56 
 
 		 532 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.94 
 
 		 527 aa  608  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.35 
 
 		 595 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  52.89 
 
 		 656 aa  593  1e-168  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.22 
 
 		 565 aa  587  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.56 
 
 		 527 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.29 
 
 		 530 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.72 
 
 		 541 aa  544  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.05 
 
 		 532 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.91 
 
 		 539 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.89 
 
 		 590 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.04 
 
 		 533 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.52 
 
 		 584 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  49.71 
 
 		 531 aa  491  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.87 
 
 		 643 aa  475  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3706  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.47 
 
 		 594 aa  475  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.74 
 
 		 550 aa  476  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.7 
 
 		 529 aa  456  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.1 
 
 		 528 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.1 
 
 		 528 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  43.12 
 
 		 589 aa  440  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.93 
 
 		 606 aa  438  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  44.17 
 
 		 562 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1598  ATP-dependent RNA helicase (cold-shock DEAD-box protein A)  49.06 
 
 		 580 aa  436  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  45.14 
 
 		 561 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.2 
 
 		 562 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  41.47 
 
 		 574 aa  435  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.97 
 
 		 467 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.59 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.88 
 
 		 525 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.88 
 
 		 538 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  49.64 
 
 		 528 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  49.88 
 
 		 529 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  49.88 
 
 		 525 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.88 
 
 		 511 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.61 
 
 		 597 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  49.64 
 
 		 528 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.64 
 
 		 528 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  49.64 
 
 		 528 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  49.64 
 
 		 533 aa  428  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.64 
 
 		 528 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.83 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.17 
 
 		 599 aa  428  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.38 
 
 		 611 aa  425  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.54 
 
 		 482 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.36 
 
 		 590 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.95 
 
 		 637 aa  428  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.62 
 
 		 546 aa  425  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.49 
 
 		 610 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0328  cold-shock inducible ATP-independent RNA helicase  43.52 
 
 		 583 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011259  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.25 
 
 		 541 aa  425  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.44 
 
 		 546 aa  422  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  44.6 
 
 		 530 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  43.18 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.18 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.47 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.59 
 
 		 605 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.6 
 
 		 651 aa  422  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.38 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.3 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.55 
 
 		 629 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  43.53 
 
 		 609 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.18 
 
 		 629 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.55 
 
 		 629 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  42.61 
 
 		 579 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.53 
 
 		 609 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.23 
 
 		 594 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.55 
 
 		 629 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  43.18 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.6 
 
 		 651 aa  422  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.18 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.18 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.18 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.6 
 
 		 651 aa  422  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.14 
 
 		 602 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.55 
 
 		 629 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.16 
 
 		 625 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  40 
 
 		 579 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04825  ATP-dependent RNA helicase  42.07 
 
 		 614 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.96 
 
 		 664 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.82 
 
 		 538 aa  413  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.25 
 
 		 574 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.31 
 
 		 640 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.31 
 
 		 640 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.88 
 
 		 646 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.13 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.31 
 
 		 640 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.71 
 
 		 664 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.66 
 
 		 634 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.71 
 
 		 664 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  42.94 
 
 		 653 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.31 
 
 		 640 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0706  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.13 
 
 		 543 aa  414  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.76 
 
 		 621 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0902  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.94 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.282889  normal  0.164162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>