More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0124 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0124  NLP/P60 family protein  100 
 
 		 159 aa  319  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0021  NLP/P60 protein  48.65 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2028  NLP/P60 protein  52.07 
 
 		 233 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0199  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 191 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  42.02 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  42.02 
 
 		 327 aa  93.6  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1402  NLP/P60 protein  44.29 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  37.04 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 369 aa  91.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  40.87 
 
 		 212 aa  91.3  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 353 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  40.52 
 
 		 364 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  38.21 
 
 		 382 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  39.66 
 
 		 354 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  39.13 
 
 		 226 aa  88.6  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 234 aa  88.2  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 363 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  40.52 
 
 		 363 aa  87.8  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  40 
 
 		 248 aa  87.8  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 363 aa  87.8  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38.14 
 
 		 224 aa  87.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  36.24 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  35.57 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  36.36 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  37.19 
 
 		 404 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 418 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  38.02 
 
 		 404 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  34.23 
 
 		 223 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  40 
 
 		 258 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  38.02 
 
 		 407 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  34.9 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  38.02 
 
 		 407 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  38.02 
 
 		 407 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  34.23 
 
 		 223 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  38.02 
 
 		 407 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  34.23 
 
 		 223 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  38.02 
 
 		 407 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  38.02 
 
 		 407 aa  86.3  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  38.02 
 
 		 404 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  31.88 
 
 		 205 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  39.67 
 
 		 197 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  39.67 
 
 		 177 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1768  NLP/P60 protein  31.21 
 
 		 325 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  37.29 
 
 		 211 aa  84.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  39.13 
 
 		 249 aa  84.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  33.33 
 
 		 224 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  39.84 
 
 		 190 aa  84  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  36.44 
 
 		 234 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  33.57 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  36.89 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  32.21 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  37.29 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  32.21 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  36.44 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  36.44 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2671  NLP/P60 protein  32.88 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.179494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  36.44 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  35.34 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  36.44 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  36.44 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  36.44 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  36.44 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2166  NLP/P60 protein  36.97 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.17 
 
 		 265 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  33.82 
 
 		 273 aa  81.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  36.44 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  33.61 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  43.14 
 
 		 523 aa  80.9  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  38.6 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 295 aa  80.9  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  39.66 
 
 		 368 aa  80.9  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  36.67 
 
 		 556 aa  80.9  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 208 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  33.1 
 
 		 228 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  34.71 
 
 		 198 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  34.75 
 
 		 222 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  34.71 
 
 		 177 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  42.45 
 
 		 556 aa  79.7  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  37.19 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  36.89 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  36.89 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  34.45 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  34.07 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  33.62 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  37.29 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  34.07 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  33.9 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  34.07 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  33.9 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  35.54 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  34.45 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  37.19 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  36.89 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  37.19 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.62 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  35.59 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  36.13 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>