More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0107 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  100 
 
 
262 aa  541  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  56.67 
 
 
284 aa  273  2e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  52.72 
 
 
320 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  44.4 
 
 
277 aa  231  7e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  47.04 
 
 
248 aa  227  1e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  6.17052e-06  hitchhiker  6.5256e-06 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  42.91 
 
 
265 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  43.8 
 
 
265 aa  218  6e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  43.7 
 
 
267 aa  212  4e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  41.24 
 
 
275 aa  212  5e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  43.18 
 
 
269 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  41.76 
 
 
275 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  41.7 
 
 
270 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  45.19 
 
 
264 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  39.62 
 
 
273 aa  193  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  41.63 
 
 
265 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  38.55 
 
 
271 aa  192  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  41.25 
 
 
262 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  41.83 
 
 
271 aa  189  3e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  6.09738e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  39.31 
 
 
278 aa  189  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  39.61 
 
 
274 aa  187  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  39.53 
 
 
262 aa  184  2e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  40.32 
 
 
263 aa  182  4e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  39.92 
 
 
268 aa  181  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  43.32 
 
 
293 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  39.38 
 
 
268 aa  178  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  40.08 
 
 
263 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  39.53 
 
 
268 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  3.10302e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  40.74 
 
 
280 aa  174  1e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  38.37 
 
 
269 aa  173  2e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  38.89 
 
 
270 aa  173  3e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  37.8 
 
 
266 aa  173  3e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  7.04965e-06  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  35.16 
 
 
267 aa  171  8e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.30567e-07  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  40.08 
 
 
266 aa  171  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  37.55 
 
 
269 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  37.16 
 
 
269 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  37.16 
 
 
269 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  38.11 
 
 
271 aa  169  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  42.31 
 
 
255 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  36.02 
 
 
270 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  37.5 
 
 
270 aa  166  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  38.96 
 
 
269 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  38.96 
 
 
269 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.65758e-06  hitchhiker  2.97579e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  38.96 
 
 
269 aa  165  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.46898e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  35.71 
 
 
270 aa  164  1e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  38.1 
 
 
274 aa  164  1e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  36.59 
 
 
298 aa  164  1e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  39.92 
 
 
272 aa  164  1e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.66595e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  35.38 
 
 
272 aa  162  4e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  41.91 
 
 
259 aa  162  4e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  38.53 
 
 
269 aa  162  4e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.56254e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  38.16 
 
 
247 aa  162  5e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  37.78 
 
 
289 aa  161  8e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51059e-07 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  36.13 
 
 
272 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  38.11 
 
 
269 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0006  peptidase M48 Ste24p  41.29 
 
 
268 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  41.29 
 
 
231 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  33.58 
 
 
267 aa  159  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  38.37 
 
 
266 aa  158  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  4.70092e-06  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  38.63 
 
 
376 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  35.64 
 
 
273 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  40.93 
 
 
268 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  37.96 
 
 
266 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  35.19 
 
 
282 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  40.5 
 
 
273 aa  153  3e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  38.98 
 
 
275 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0007  peptidase M48 Ste24p  39.53 
 
 
271 aa  152  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0007  hypothetical protein  39.53 
 
 
271 aa  151  9e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  35.09 
 
 
258 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  39.67 
 
 
273 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  36.29 
 
 
272 aa  149  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 
272 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  35.29 
 
 
427 aa  145  7e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  33.45 
 
 
271 aa  145  7e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  32.47 
 
 
268 aa  144  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  32.61 
 
 
272 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  32.95 
 
 
278 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  32.61 
 
 
279 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  29.71 
 
 
492 aa  139  4e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  32.46 
 
 
254 aa  138  9e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  3.19394e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  34.13 
 
 
432 aa  137  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  31.33 
 
 
489 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  33.08 
 
 
282 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  34.41 
 
 
264 aa  136  3e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  33.46 
 
 
273 aa  137  3e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  33.99 
 
 
278 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  32.7 
 
 
513 aa  135  7e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 
285 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  35.71 
 
 
271 aa  134  1e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 
284 aa  134  2e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  38.6 
 
 
268 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  2.69933e-07 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45606  predicted protein  33.46 
 
 
366 aa  131  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  34.54 
 
 
268 aa  130  2e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.40796e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  35.62 
 
 
284 aa  130  2e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.21 
 
 
268 aa  127  2e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  35.82 
 
 
423 aa  127  2e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  26.3 
 
 
268 aa  126  4e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  33.65 
 
 
285 aa  125  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  36.52 
 
 
291 aa  125  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06650  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 
418 aa  125  8e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  31.8 
 
 
479 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>