64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0095 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  100 
 
 		 195 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  43.17 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  44.2 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  50.93 
 
 		 1128 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  50.89 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  45.6 
 
 		 187 aa  147  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  38.92 
 
 		 190 aa  147  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  44.62 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  44.63 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  39.25 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  37.84 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  40.98 
 
 		 195 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  37.3 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  37.3 
 
 		 190 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  37.3 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  37.3 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  37.3 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  37.3 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  36.76 
 
 		 190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  36.76 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  36.76 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  42.94 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  44.57 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  45.45 
 
 		 192 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  40.12 
 
 		 188 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  40.12 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  45.29 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  39.13 
 
 		 187 aa  128  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  39.13 
 
 		 187 aa  128  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  49.65 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  35.59 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  42.22 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  35.14 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  37.19 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  44.58 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  38.32 
 
 		 188 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  39.41 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  41.54 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  36.47 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  31.02 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  30.48 
 
 		 183 aa  111  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  44.52 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  44.58 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  30.3 
 
 		 194 aa  105  6e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  44 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  32.57 
 
 		 181 aa  97.8  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  29.95 
 
 		 475 aa  61.6  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  36.14 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  45.1 
 
 		 423 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  24.39 
 
 		 285 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.84 
 
 		 234 aa  45.1  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.63 
 
 		 416 aa  44.7  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0633  SAM-dependent methyltransferase  29.1 
 
 		 173 aa  44.7  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  39.06 
 
 		 262 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  24.59 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 409 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0116  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  32.79 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.889427  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  32 
 
 		 247 aa  42  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  29.31 
 
 		 410 aa  41.6  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2844  methyltransferase FkbM  32.35 
 
 		 312 aa  41.2  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0186  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase (sun family protein)  41.3 
 
 		 416 aa  41.2  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.216651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1076  Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  44.9 
 
 		 176 aa  41.2  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  43.14 
 
 		 420 aa  41.2  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>