235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0086 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0086  dihydropteridine reductase  100 
 
 
218 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001134  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  57.48 
 
 
217 aa  269  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0581  dihydropteridine reductase  52.34 
 
 
217 aa  252  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3061  dihydropteridine reductase  57.69 
 
 
217 aa  252  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201865  normal  0.0102735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0911  dihydropteridine reductase  57.69 
 
 
217 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.914181  normal  0.698388 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0876  dihydropteridine reductase  57.69 
 
 
217 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.665426  normal  0.300688 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3715  dihydropteridine reductase  57.69 
 
 
217 aa  247  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3034  dihydropteridine reductase  57.21 
 
 
217 aa  247  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0617  dihydropteridine reductase  54.81 
 
 
217 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0966  dihydropteridine reductase  55.77 
 
 
217 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0977  dihydropteridine reductase  55.77 
 
 
217 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0943  dihydropteridine reductase  55.77 
 
 
217 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3396  dihydropteridine reductase  55.77 
 
 
217 aa  245  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00273411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0674  dihydropteridine reductase  54.33 
 
 
217 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0725531  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0631  dihydropteridine reductase  54.33 
 
 
217 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0690  dihydropteridine reductase  54.33 
 
 
217 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.478086  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0625  dihydropteridine reductase  51.87 
 
 
217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3068  dihydropteridine reductase  51.87 
 
 
217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.260061  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0659  dihydropteridine reductase  51.87 
 
 
217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0596  dihydropteridine reductase  51.4 
 
 
217 aa  238  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3051  6,7-dihydropteridine reductase  51.4 
 
 
217 aa  237  8e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00539  dihydropteridine reductase, NAD(P)H-dependent, oxygen-insensitive  51.4 
 
 
217 aa  237  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00528  hypothetical protein  51.4 
 
 
217 aa  237  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.884755  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0472  dihydropteridine reductase  51.4 
 
 
217 aa  235  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0596  dihydropteridine reductase  51.4 
 
 
217 aa  235  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.727984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1074  dihydropteridine reductase  50.23 
 
 
217 aa  232  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.381484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3785  dihydropteridine reductase  55.29 
 
 
217 aa  231  5e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1024  dihydropteridine reductase  52.13 
 
 
218 aa  231  9e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0405411  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1868  dihydropteridine reductase  48.57 
 
 
216 aa  225  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2932  dihydropteridine reductase  57.21 
 
 
217 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0688  dihydropteridine reductase  54.81 
 
 
217 aa  222  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.169469  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3263  dihydropteridine reductase  49.03 
 
 
217 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2077  dihydropteridine reductase  48.06 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2432  dihydropteridine reductase  48.54 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24750  dihydropteridine reductase  51.4 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2684  dihydropteridine reductase  51.44 
 
 
217 aa  209  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3066  dihydropteridine reductase  46.12 
 
 
217 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.612691  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3717  dihydropteridine reductase  48.34 
 
 
220 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2015  dihydropteridine reductase  50 
 
 
216 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.214277  normal  0.0457952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3894  nitroreductase  34.25 
 
 
218 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2794  nitroreductase  33.95 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2969  nitroreductase  35.81 
 
 
218 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1409  nitroreductase  34.43 
 
 
218 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4747  nitroreductase family protein  33.49 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.85334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1017  nitroreductase  32.57 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2510  nitroreductase  33.33 
 
 
218 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000360  oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase/dihydropteridine reductase  33.33 
 
 
237 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06175  NAD(P)H-dependent flavin reductase  32.11 
 
 
218 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2454  nitroreductase  31.67 
 
 
218 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313556  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2137  nitroreductase  36.15 
 
 
215 aa  119  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0778  NAD(P)H nitroreductase  31.84 
 
 
220 aa  118  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0026225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1659  nitroreductase  31.16 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.993555 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1997  nitroreductase  32.86 
 
 
219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1067  nitroreductase  31.46 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06275  hypothetical protein  29.38 
 
 
214 aa  106  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3134  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32 
 
 
227 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3121  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32 
 
 
227 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.203364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3380  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  32 
 
 
227 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3809  nitroreductase  33.33 
 
 
216 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3058  nitroreductase  29.41 
 
 
226 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3355  nitroreductase family protein  31.5 
 
 
226 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1898  nitroreductase family protein  30.46 
 
 
227 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2086  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.28 
 
 
220 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4445  nitroreductase  31.02 
 
 
220 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3333  nitroreductase family protein  31 
 
 
227 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0484  nitroreductase  30.73 
 
 
200 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.055652  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0114  nitroreductase  31.02 
 
 
201 aa  99.4  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.774801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3028  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31 
 
 
227 aa  99  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.67044  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1440  nitroreductase  30.7 
 
 
215 aa  98.6  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.144081  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3358  nitroreductase family protein  30.5 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2079  nitroreductase  32.37 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108575  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2546  nitroreductase  29.21 
 
 
223 aa  92  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000186269  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2598  nitroreductase  29.21 
 
 
223 aa  92  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0170775  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5654  nitroreductase  27.27 
 
 
223 aa  91.7  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.113435 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1679  nitroreductase  30.58 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  27.62 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0341  nitroreductase family protein  28.72 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0277871  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1939  putative NAD(P)H nitroreductase  28.06 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00873643  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0736  nitroreductase  27.23 
 
 
211 aa  88.6  6e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000777903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2772  nitroreductase  26.85 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1154  nitroreductase  26.73 
 
 
208 aa  87  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000238849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0326  nitroreductase  26.94 
 
 
212 aa  87  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1196  nitroreductase  27.93 
 
 
235 aa  85.9  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.473122 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2134  nitroreductase family protein  28.21 
 
 
206 aa  85.9  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2693  nitroreductase  31.37 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.719642  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4012  nitroreductase  26.27 
 
 
233 aa  85.9  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2776  Ricin B lectin  32.41 
 
 
215 aa  85.5  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427559 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2206  nitroreductase family protein  24.88 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00142362  hitchhiker  5.10468e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4487  nitroreductase  29.03 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2761  NAD(P)H nitroreductase  24.88 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3031  NAD  24.88 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0250  nitroreductase  28.84 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.269475  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2798  NAD(P)H nitroreductase  24.88 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2000  nitroreductase  24.07 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3044  nitroreductase  24.41 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0768  nitroreductase  26.13 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10128  nitroreductase family protein  26.61 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1158  nitroreductase  23.74 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0173  nitroreductase family protein  27.52 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2066  nitroreductase  29.45 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>