More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0077 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0077  diguanylate cyclase  100 
 
 		 411 aa  810    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.978885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0840  diguanylate cyclase  39.8 
 
 		 411 aa  239  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0736  diguanylate cyclase  38.11 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000330305  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2632  GGDEF domain-containing protein  37.08 
 
 		 411 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2380  GGDEF family protein  31.63 
 
 		 413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0242852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3052  diguanylate cyclase  34.15 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0020  diguanylate cyclase  32.76 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0245  GGDEF domain-containing protein  38.27 
 
 		 417 aa  186  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3267  diguanylate cyclase  36.32 
 
 		 381 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1771  diguanylate cyclase  41.63 
 
 		 362 aa  186  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4080  diguanylate cyclase  39.5 
 
 		 439 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3991  diguanylate cyclase  40.87 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0206  GGDEF domain-containing protein  50.52 
 
 		 396 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4678  GGDEF  40.88 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1703  diguanylate cyclase  36.66 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00246889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0186  diguanylate cyclase  38.08 
 
 		 398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000123  GGDEF domain protein  32.82 
 
 		 412 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.608204  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1377  diguanylate cyclase  46.67 
 
 		 411 aa  167  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1358  diguanylate cyclase  39.85 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0505  GGDEF domain protein  36.24 
 
 		 431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0369  GGDEF domain-containing protein  36.53 
 
 		 400 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0652441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0399  diguanylate cyclase  35.73 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0395  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0325  diguanylate cyclase  38.79 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320199  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05730  sensory transduction protein kinase  49.72 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0436  membrane associated GGDEF protein  35.44 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4833  diguanylate cyclase  37.06 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0493  GGDEF family protein  43.88 
 
 		 412 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0380455  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4000  diguanylate cyclase  45.9 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.133602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3494  diguanylate cyclase  41.23 
 
 		 384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5168  diguanylate cyclase  47.96 
 
 		 442 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0747  diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 508 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1795  diguanylate cyclase  39.13 
 
 		 339 aa  117  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  39.56 
 
 		 565 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2748  diguanylate cyclase  37.84 
 
 		 651 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0199433  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2974  diguanylate cyclase  36.93 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0516794  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0891  diguanylate cyclase  36.9 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  38.73 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1879  diguanylate cyclase  34.5 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  33.97 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1741  diguanylate cyclase  34.21 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2596  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0498  diguanylate cyclase  37.82 
 
 		 461 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.98 
 
 		 454 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00466  Putative two-component system regulatory protein with GGDEF domain  37.57 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.6149  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2198  diguanylate cyclase  40.24 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.83837  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2197  GGDEF family protein  39.63 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  40.46 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2446  diguanylate cyclase  34.06 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0209282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2275  diguanylate cyclase  40.24 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3807  diguanylate cyclase  39.31 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.36 
 
 		 550 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  41.71 
 
 		 457 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4649  diguanylate cyclase  39.31 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06694  hypothetical protein  37.29 
 
 		 337 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  38.38 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3714  diguanylate cyclase  39.31 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.45 
 
 		 457 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0489  diguanylate cyclase  41.52 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1928  diguanylate cyclase  36.99 
 
 		 365 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.851461 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  33.63 
 
 		 464 aa  106  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  38.33 
 
 		 696 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1291  diguanylate cyclase  36.93 
 
 		 518 aa  106  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2084  diguanylate cyclase  40.94 
 
 		 417 aa  106  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000571313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2514  diguanylate cyclase  33.51 
 
 		 341 aa  106  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.39605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1748  diguanylate cyclase  40.94 
 
 		 417 aa  106  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  40.46 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  35.75 
 
 		 523 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2750  diguanylate cyclase  36.18 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2312  GGDEF domain-containing protein  34.25 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  40 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2418  GGDEF domain-containing protein  36.93 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.659104 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2754  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1831  diguanylate cyclase  34.06 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0533362  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  40.57 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  40.34 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2126  diguanylate cyclase  39.55 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128443  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0968  diguanylate cyclase  42.33 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2408  diguanylate cyclase  39.02 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.54 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5543  GGDEF domain-containing protein  32.63 
 
 		 352 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1373  diguanylate cyclase  36.93 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2986  diguanylate cyclase  36.93 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000165218 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  31.6 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2485  diguanylate cyclase  39.08 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1398  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0531857  decreased coverage  0.00306238 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1845  diguanylate cyclase  33.91 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2714  diguanylate cyclase  35.8 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000423102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2782  diguanylate cyclase  35.8 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.32181  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1359  diguanylate cyclase  36.36 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2748  diguanylate cyclase  37.28 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246546  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1479  diguanylate cyclase  38.64 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2096  diguanylate cyclase  40.32 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3458  diguanylate cyclase  35.75 
 
 		 518 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000037754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3549  diguanylate cyclase  39.41 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1227  diguanylate cyclase  37.43 
 
 		 554 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.594022  normal  0.072002 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0283  GGDEF family protein  36.72 
 
 		 339 aa  103  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.286485  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  35.39 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0162  diguanylate cyclase  37.43 
 
 		 614 aa  103  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.67 
 
 		 317 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>