238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0076 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  100 
 
 		 355 aa  728    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  74.57 
 
 		 350 aa  521  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  74.57 
 
 		 350 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  64.71 
 
 		 378 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  66.86 
 
 		 348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  61.54 
 
 		 350 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.74 
 
 		 342 aa  349  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  54.93 
 
 		 343 aa  347  2e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  54.93 
 
 		 343 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  51.79 
 
 		 354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  53.59 
 
 		 346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  51.34 
 
 		 349 aa  343  4e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  54.79 
 
 		 346 aa  342  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  54.17 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  57.69 
 
 		 344 aa  339  5e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  54.76 
 
 		 346 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.89 
 
 		 369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.73 
 
 		 346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  52.68 
 
 		 346 aa  326  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.43 
 
 		 354 aa  326  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.49 
 
 		 357 aa  325  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  52.68 
 
 		 346 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  51.51 
 
 		 342 aa  323  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  48.85 
 
 		 358 aa  318  7.999999999999999e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  51.79 
 
 		 352 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.62 
 
 		 351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  53.8 
 
 		 337 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.94 
 
 		 346 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.94 
 
 		 346 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  50.43 
 
 		 350 aa  311  9e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.43 
 
 		 350 aa  311  9e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  51.72 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.05 
 
 		 348 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  52.35 
 
 		 353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  50.29 
 
 		 355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.6 
 
 		 345 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  49.26 
 
 		 337 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.71 
 
 		 358 aa  301  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  48.51 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  47.32 
 
 		 321 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  47.45 
 
 		 323 aa  300  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.29 
 
 		 354 aa  299  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  50.6 
 
 		 346 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.09 
 
 		 348 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  55.15 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  46.85 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  55.15 
 
 		 339 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  51.34 
 
 		 349 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.4 
 
 		 350 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  49.85 
 
 		 334 aa  295  8e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.8 
 
 		 348 aa  295  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.8 
 
 		 348 aa  295  8e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.8 
 
 		 347 aa  295  9e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  46.24 
 
 		 345 aa  294  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.09 
 
 		 347 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  47.15 
 
 		 321 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.24 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.21 
 
 		 348 aa  293  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  48.66 
 
 		 346 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.8 
 
 		 348 aa  293  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  53.29 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  51.62 
 
 		 354 aa  292  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  55.45 
 
 		 339 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.21 
 
 		 348 aa  292  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.98 
 
 		 329 aa  291  9e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  49.28 
 
 		 351 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.72 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.49 
 
 		 347 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.45 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  50.3 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.41 
 
 		 345 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.49 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  48.69 
 
 		 327 aa  288  7e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.21 
 
 		 348 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.99 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.62 
 
 		 353 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.49 
 
 		 354 aa  285  5.999999999999999e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  49.25 
 
 		 344 aa  285  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0573  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  52.77 
 
 		 354 aa  285  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  47.26 
 
 		 348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.76 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  44.44 
 
 		 347 aa  282  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.32 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.34 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.55 
 
 		 349 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.55 
 
 		 349 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  48.77 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  51.7 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.39 
 
 		 358 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.09 
 
 		 358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  48.21 
 
 		 351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.51 
 
 		 358 aa  273  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.21 
 
 		 364 aa  273  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  48.65 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0639  aIF-2BI family translation initiation factor  43.9 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0913  translation initiation factor 2B subunit I  52.76 
 
 		 346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.659043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.34 
 
 		 353 aa  270  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.33 
 
 		 349 aa  269  5e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  45.13 
 
 		 349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.55 
 
 		 365 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>