More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0074 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0074  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
276 aa  567  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0185  TatD family hydrolase  63.97 
 
 
278 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2230  hydrolase, TatD family  62.13 
 
 
273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0780  hydrolase, TatD family  58.91 
 
 
273 aa  335  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3219  hydrolase, TatD family  53.82 
 
 
272 aa  293  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0721  hydrolase, TatD family  49.45 
 
 
280 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00103897  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  40.7 
 
 
457 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  39.69 
 
 
461 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  36.72 
 
 
464 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  36.36 
 
 
255 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  36.36 
 
 
255 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  38.34 
 
 
606 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  36.36 
 
 
255 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.36 
 
 
255 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.97 
 
 
255 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  37.01 
 
 
255 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  35.97 
 
 
255 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.97 
 
 
255 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  37.94 
 
 
458 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  35.97 
 
 
255 aa  188  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  43.31 
 
 
258 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  35.57 
 
 
255 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  43.31 
 
 
258 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  37.94 
 
 
462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  37.15 
 
 
458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  35.32 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  33.6 
 
 
255 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  35.16 
 
 
462 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  42.52 
 
 
258 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1582  TatD family hydrolase  38.19 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.696135  normal  0.554406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  35.83 
 
 
256 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  37.01 
 
 
263 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  37.15 
 
 
257 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  37.01 
 
 
263 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.57 
 
 
257 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  35.55 
 
 
268 aa  176  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  37.8 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.16 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  41.18 
 
 
261 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2211  TatD family hydrolase  36.96 
 
 
280 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2940  Sec-independent protein translocase TatD  34.51 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.355408  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  36.36 
 
 
258 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  34.25 
 
 
256 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 
270 aa  169  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  34.25 
 
 
256 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  37.4 
 
 
267 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  36.19 
 
 
283 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  36.51 
 
 
260 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  32.55 
 
 
256 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  36.19 
 
 
283 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  36.19 
 
 
283 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  36.33 
 
 
262 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  35.43 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  38.43 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  32.16 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  32.16 
 
 
256 aa  166  4e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0747  TatD family hydrolase  36.12 
 
 
271 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0672  TatD family hydrolase  35.74 
 
 
271 aa  165  9e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  33.46 
 
 
255 aa  165  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  31.62 
 
 
255 aa  165  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1769  TatD family hydrolase  36.19 
 
 
266 aa  165  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.655605 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  33.07 
 
 
255 aa  165  9e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  37.55 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  35.55 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  35.97 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  30.95 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  37.74 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  37.08 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  37.7 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1664  TatD family hydrolase  36.19 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1739  TatD family hydrolase  36.19 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.50309  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  32.14 
 
 
251 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  36.08 
 
 
259 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2029  TatD-related deoxyribonuclease  39.77 
 
 
267 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  35.94 
 
 
262 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  38.49 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0910  TatD family hydrolase  33.33 
 
 
251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  35.16 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  35.18 
 
 
260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  32 
 
 
260 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  35.91 
 
 
262 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0740  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 
270 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  35.14 
 
 
262 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  32.81 
 
 
257 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  37.84 
 
 
257 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  34.77 
 
 
267 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  38.58 
 
 
259 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  32.81 
 
 
257 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  37.69 
 
 
280 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1926  TatD family hydrolase  35.02 
 
 
262 aa  159  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  37.18 
 
 
273 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  33.33 
 
 
265 aa  159  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  36.47 
 
 
262 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  36.65 
 
 
268 aa  159  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  34.51 
 
 
255 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  31.47 
 
 
256 aa  159  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  38.13 
 
 
264 aa  158  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  35.29 
 
 
459 aa  158  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2645  TatD family hydrolase  34.77 
 
 
262 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  35.97 
 
 
259 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>