More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0070 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0070  Ste24 endopeptidase  100 
 
 
427 aa  844    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1728  Ste24 endopeptidase  42.55 
 
 
415 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1605  Ste24 endopeptidase  42.48 
 
 
412 aa  333  3e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1513  Ste24 endopeptidase  42.55 
 
 
421 aa  327  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0941  CAAX prenyl protease 1, putative  39.81 
 
 
422 aa  313  5.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1902  Ste24 endopeptidase  40.47 
 
 
419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0130115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1027  Ste24 endopeptidase  39.39 
 
 
418 aa  298  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275496  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1716  Ste24 endopeptidase  38.39 
 
 
428 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0495  Ste24 endopeptidase  40.19 
 
 
413 aa  279  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08781  CAAX prenyl protease 1, putative  42.54 
 
 
411 aa  278  2e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0886  Ste24 endopeptidase  41.79 
 
 
410 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.806997  normal  0.37973 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2401  Ste24 endopeptidase  41.77 
 
 
415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1393  Zn-dependent protease with chaperone function  34.38 
 
 
418 aa  251  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.498357 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0538  M48 family peptidase  37.7 
 
 
453 aa  229  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1607  Ste24 endopeptidase  38.07 
 
 
416 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2357  Ste24 endopeptidase  38.4 
 
 
411 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0568  peptidase M48 Ste24p  36.7 
 
 
419 aa  223  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  34.87 
 
 
417 aa  222  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0581  Ste24 endopeptidase  36.17 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00216679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2782  Ste24 endopeptidase  41.25 
 
 
414 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1512  Ste24 endopeptidase  38.17 
 
 
416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00450516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1036  Ste24 endopeptidase  37.44 
 
 
419 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0957  Ste24 endopeptidase  36.73 
 
 
419 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.819496  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0598  Ste24 endopeptidase  37.2 
 
 
419 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608045  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0953  Ste24 endopeptidase  36.49 
 
 
419 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1077  Ste24 endopeptidase  37.2 
 
 
419 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28833  predicted protein  33.9 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1511  Ste24 endopeptidase  37.89 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5337  Ste24 endopeptidase  35.59 
 
 
675 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296038  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1993  Ste24 endopeptidase  38.3 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0181  Ste24 endopeptidase  36.42 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35752  zinc metalloprotease  30.84 
 
 
452 aa  212  9e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.998958  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0777  Ste24 endopeptidase  37.62 
 
 
419 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0537481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  36.54 
 
 
421 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000135832  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1474  Ste24 endopeptidase  39.35 
 
 
418 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.493815  normal  0.267224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2695  Ste24 endopeptidase  36.27 
 
 
437 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3347  Ste24 endopeptidase  36.27 
 
 
437 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0410765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3002  peptidase M48, Ste24p  40.13 
 
 
416 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.891499  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1015  M48 family peptidase  38.1 
 
 
419 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  33.03 
 
 
417 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0984  Ste24 endopeptidase  41.42 
 
 
427 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2969  Ste24 endopeptidase  37.17 
 
 
419 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.22669 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0359  Ste24 endopeptidase  30.37 
 
 
406 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0342  Ste24 endopeptidase  37.92 
 
 
418 aa  207  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1393  putative FtsZ-like Zn-dependent protease  36.43 
 
 
425 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.222302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2226  Ste24 endopeptidase  38 
 
 
419 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4191  Ste24 endopeptidase  36.97 
 
 
419 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0318  M48 family peptidase  35.26 
 
 
414 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2575  peptidase M48, Ste24p  37.24 
 
 
469 aa  203  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.958701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2454  Ste24 endopeptidase  34.85 
 
 
414 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0713  Ste24 endopeptidase  40.07 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.442824  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1411  Ste24 endopeptidase  41.29 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04910  metalloendopeptidase, putative  33.26 
 
 
460 aa  199  9e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0632  Ste24 endopeptidase  37.54 
 
 
415 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.035842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1469  Ste24 endopeptidase  37.78 
 
 
429 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.365872  normal  0.600215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2347  Ste24 endopeptidase  36.28 
 
 
410 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441735 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2959  peptidase  37.76 
 
 
419 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.918636  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2849  M48 family peptidase  37.76 
 
 
419 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2909  M48 family peptidase  37.76 
 
 
419 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1482  Ste24 endopeptidase  35.78 
 
 
421 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2536  M48 family peptidase  37.3 
 
 
421 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453397  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0393  M48 family peptidase  37.3 
 
 
421 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.980024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0909  M48 family peptidase  37.3 
 
 
421 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0238  M48 family peptidase  37.3 
 
 
421 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2912  Ste24 endopeptidase  41.12 
 
 
422 aa  194  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1669  M48 family peptidase  37.08 
 
 
419 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11231  CaaX prenyl protease [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7SI78]  35.56 
 
 
456 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.306562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1699  Ste24 endopeptidase  38.77 
 
 
429 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1148  Ste24 endopeptidase  30.29 
 
 
406 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1388  Ste24 endopeptidase  31.97 
 
 
435 aa  190  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.165518  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0671  Ste24 endopeptidase  36.59 
 
 
424 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.188176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1892  Ste24 endopeptidase  36.1 
 
 
453 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35497  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1350  Ste24 endopeptidase  38.38 
 
 
421 aa  184  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276793  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1820  M48 family peptidase  35.96 
 
 
399 aa  184  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.836146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3199  Ste24 endopeptidase  35.09 
 
 
420 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0906  Ste24 endopeptidase  36 
 
 
427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380064  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0941  integral membrane protease transmembrane protein  39.43 
 
 
418 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0177429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0812  Ste24 endopeptidase  38.97 
 
 
419 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.46972  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1431  Ste24 endopeptidase  34.46 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00867901  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0883  Ste24 endopeptidase  38.97 
 
 
422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1320  Ste24 endopeptidase  32.45 
 
 
433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.465026  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0542  M48 family peptidase  31.01 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0618  M48 family peptidase  32.15 
 
 
404 aa  172  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.360311  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1613  XRE family transcriptional regulator  33.88 
 
 
400 aa  170  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0323  Ste24 endopeptidase  35.41 
 
 
434 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.592332  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33410  predicted protein  33.44 
 
 
345 aa  162  9e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.841869  normal  0.225834 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63669  predicted protein  29.14 
 
 
452 aa  160  5e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000327085 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1723  Ste24 endopeptidase  32.7 
 
 
375 aa  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1231  Ste24 endopeptidase  31.67 
 
 
413 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0560112  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0570  peptidase, M48 family  29.39 
 
 
395 aa  149  9e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.802538  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0823  M48 family peptidase  27.63 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0746  M48 family peptidase  27.63 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.197295  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1283  M48 family peptidase  27.3 
 
 
395 aa  144  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.741961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0572  Ste24 endopeptidase  31.61 
 
 
389 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.209932 
 
 
-
 
NC_002936  DET1423  M48 family peptidase  30.6 
 
 
392 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.620606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2951  Ste24 endopeptidase  30.89 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0005  peptidase M48, Ste24p  31.03 
 
 
392 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2331  Ste24 endopeptidase  28.41 
 
 
405 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0205695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1885  Ste24 endopeptidase  31.97 
 
 
398 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1205  peptidase, M48 family  26.81 
 
 
392 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>