More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0068 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0068  DNA replication and repair protein RecR  100 
 
 		 198 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0187  recombination protein RecR  78.28 
 
 		 201 aa  329  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.957201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2271  recombination protein RecR  76.26 
 
 		 201 aa  322  2e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2147  recombination protein RecR  70.71 
 
 		 202 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0508  recombination protein RecR  59.09 
 
 		 203 aa  264  7e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0196  recombination protein RecR  58.59 
 
 		 201 aa  253  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2128  recombination protein RecR  41.92 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505322  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0297  recombination protein RecR  40.31 
 
 		 199 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0029  DNA replication and repair protein RecR  40.91 
 
 		 199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.157728  hitchhiker  0.00000915246 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12031  recombination protein RecR  38.78 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0259  recombination protein RecR  40.72 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11881  recombination protein RecR  37.24 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0044  recombination protein RecR  39.29 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0424851  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1108  recombination protein RecR  37.76 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425444  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12041  recombination protein RecR  38.27 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0370  recombination protein RecR  37.88 
 
 		 199 aa  158  5e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0022  recombination protein RecR  35.53 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5292  recombination protein RecR  35.53 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000931615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0028  recombination protein RecR  35.53 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0021  recombination protein RecR  35.53 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0021  recombination protein RecR  35.53 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00242068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0026  recombination protein RecR  35.53 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0025  recombination protein RecR  35.53 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0021  recombination protein RecR  35.53 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000073919  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0792  recombination protein RecR  33.5 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0020  recombination protein RecR  35.53 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00591739  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1839  recombination protein RecR  43.65 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165637  normal  0.471383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0018  recombination protein RecR  36.04 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0032  recombination protein RecR  40 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000244009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0023  recombination protein RecR  35.53 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0021  recombination protein RecR  35.53 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0593  recombination protein RecR  36.41 
 
 		 199 aa  154  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0531  recombination protein RecR  41.15 
 
 		 197 aa  154  8e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0553702  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1365  recombination protein RecR  37.37 
 
 		 200 aa  154  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0020  recombination protein RecR  35.03 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1973  recombination protein RecR  36.73 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0116  recombination protein RecR  37.06 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0117  recombination protein RecR  39.49 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000471102  normal  0.0497522 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1180  recombination protein RecR  36.92 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2791  recombination protein RecR  40.51 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0094882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1207  recombination protein RecR  36.92 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.262054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3924  recombination protein RecR  38.89 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00096202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1175  recombination protein RecR  39.09 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000261474  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0514  recombination protein RecR  37.06 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0501  recombination protein RecR  37.06 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00457535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0094  recombination protein RecR  38.02 
 
 		 199 aa  151  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.427132  hitchhiker  0.00000395528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4573  recombination protein RecR  43.88 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0033  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00162242  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1549  recombination protein RecR  39.27 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00118167  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0032  recombination protein RecR  40.21 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6868  recombination protein RecR  36.27 
 
 		 201 aa  148  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.296067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0023  recombination protein RecR  40.61 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622257  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1728  recombination protein RecR  41.71 
 
 		 195 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000187366  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0032  recombination protein RecR  40.61 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0840728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1075  recombination protein RecR  40.93 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4074  recombination protein RecR  37.63 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0258  recombination protein RecR  39.49 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0250  recombination protein RecR  40.62 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0386  recombination protein RecR  34.52 
 
 		 198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.147094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0035  recombination protein RecR  35.38 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000323966  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0276  recombination protein RecR  39.59 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1189  recombination protein RecR  38.07 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00843682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4394  recombination protein RecR  38.14 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3530  recombination protein RecR  37.31 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.188089  normal  0.594809 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0876  recombination protein RecR  37.37 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1337  recombinational DNA repair protein  35.57 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.43328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1288  recombination protein RecR  37.31 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20770  recombination protein RecR  35.86 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.21986e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0108  recombination protein RecR  35.53 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0193  recombination protein RecR  40 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.54722e-32 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1240  recombination protein RecR  38.58 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3680  recombination protein RecR  35.6 
 
 		 189 aa  145  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3471  RecR protein  43.16 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177625  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0899  recombination protein RecR  38.3 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213296  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1416  recombination protein RecR  35.33 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.48434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0230  recombination protein RecR  40.41 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.601647  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4182  recombination protein RecR  35.03 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.406178  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1508  recombination protein RecR  40.41 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0537537  normal  0.426443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0210  recombination protein RecR  40 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00238733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1284  recombination protein RecR  39.39 
 
 		 204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.722454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3420  recombination protein RecR  39.58 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000418809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2171  recombination protein RecR  35.08 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04720  DNA replication and repair protein RecR  37.31 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.41163  normal  0.431257 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0651  DNA replication and repair protein RecR  36.96 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.121722  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14831  RecR protein  36.96 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.409588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1369  recombination protein RecR  36.92 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0254  recombination protein RecR  40.1 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.185022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01600  DNA replication and repair protein RecR  36.79 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053602 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1740  DNA replication and repair protein RecR  39.79 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000762461  normal  0.0361777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0017  DNA replication and repair protein RecR  34.85 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2367  recombination protein RecR  38.46 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.424518  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4814  recombination protein RecR  36.41 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1180  recombination protein RecR  38.38 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2253  recombination protein RecR  35.29 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00314078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0712  recombination protein RecR  38.46 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0557  recombination protein RecR  34.87 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0625  recombination protein RecR  34.22 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_522  recombination protein  34.87 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0417916  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1045  recombination protein RecR  34.67 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.414763  normal  0.641702 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0540  recombination protein RecR  36.55 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000530295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>