More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0067 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  199  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  68.93 
 
 
103 aa  150  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  61 
 
 
100 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  54.37 
 
 
103 aa  127  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  62 
 
 
104 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  54.37 
 
 
103 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  57.43 
 
 
102 aa  123  9e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  59.22 
 
 
103 aa  122  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  57.43 
 
 
102 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  54.9 
 
 
104 aa  120  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  56.57 
 
 
99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  55.67 
 
 
102 aa  117  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  61.63 
 
 
104 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  59.57 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  54.46 
 
 
110 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  52.48 
 
 
113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  48.04 
 
 
104 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  45.1 
 
 
104 aa  105  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  49 
 
 
102 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  48 
 
 
112 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  49.51 
 
 
108 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  51 
 
 
98 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  47.57 
 
 
104 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  47.47 
 
 
101 aa  101  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  45.1 
 
 
115 aa  100  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  45.1 
 
 
104 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  45.1 
 
 
104 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  45.1 
 
 
104 aa  98.2  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  47.42 
 
 
105 aa  97.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  47.96 
 
 
99 aa  97.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  48.42 
 
 
113 aa  97.1  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  49.47 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  59.38 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  48.45 
 
 
101 aa  96.3  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  44.66 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  44.66 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  47.06 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  46 
 
 
127 aa  94.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  48.04 
 
 
104 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  42.72 
 
 
103 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5292  hypothetical protein  51.16 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  43.56 
 
 
100 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  45.36 
 
 
112 aa  90.9  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  44.55 
 
 
100 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3472  hypothetical protein  44 
 
 
107 aa  90.1  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.153266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  51.22 
 
 
108 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  42 
 
 
107 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  45.28 
 
 
116 aa  88.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  48.78 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  48.78 
 
 
109 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  43.3 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  40.4 
 
 
103 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  47.56 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  47.56 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  47.56 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  47.56 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  47.56 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  47.56 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  39.39 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  47.56 
 
 
109 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3761  hypothetical protein  43.43 
 
 
103 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.5138  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  43.3 
 
 
118 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  39.39 
 
 
103 aa  87.4  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  50 
 
 
109 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  40 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  50.62 
 
 
105 aa  84  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  47.5 
 
 
109 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  46.59 
 
 
101 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  47.44 
 
 
119 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  37 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  37 
 
 
107 aa  82.4  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  37 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  49.37 
 
 
100 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  42.57 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1190  hypothetical protein  44 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0238697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  80.5  0.000000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  43.43 
 
 
102 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  41.84 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  43.56 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  43.56 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  40.82 
 
 
108 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  37 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  48.15 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  38.78 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  36.73 
 
 
109 aa  80.1  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  48.15 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  43.62 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1174  hypothetical protein  43 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000370902  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  40.43 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  37.62 
 
 
108 aa  78.2  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  39 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  37.76 
 
 
110 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  39 
 
 
107 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  37.76 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1311  hypothetical protein  37.76 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000397187  normal  0.0452389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  39.8 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1285  hypothetical protein  42 
 
 
109 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.496874  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  37.76 
 
 
120 aa  77  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  38.78 
 
 
109 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>