26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0063 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0063  putative lipoprotein  100 
 
 
487 aa  1003    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2266  putative lipoprotein  52.05 
 
 
512 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0192  putative lipoprotein  48.71 
 
 
462 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.462434  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1878  putative lipoprotein  49.24 
 
 
497 aa  420  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.240603  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0592  purine nucleoside phosphorylase  46.15 
 
 
437 aa  390  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192915  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0418  hypothetical protein  44.17 
 
 
432 aa  373  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0214  hypothetical protein  44.33 
 
 
439 aa  373  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1534  hypothetical protein  45.1 
 
 
464 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1344  hypothetical protein  44.85 
 
 
464 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0365  hypothetical protein  44.85 
 
 
464 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1534  hypothetical protein  41.65 
 
 
462 aa  367  1e-100  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1692  putative periplasmic protein  38.05 
 
 
435 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1380  putative periplasmic protein  39.64 
 
 
431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00930518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2202  hypothetical protein  39.46 
 
 
617 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1132  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.67 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0312  hypothetical protein  30.13 
 
 
293 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5008  deacylase-like protein  34.86 
 
 
293 aa  60.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3277  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  27.01 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1176  deacylase-like protein  26.42 
 
 
314 aa  55.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6127  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  33.04 
 
 
346 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9972  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0590  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.38 
 
 
299 aa  47.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5425  Succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  32.17 
 
 
337 aa  47  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862151  normal  0.958012 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4430  succinylglutamate desuccinylase/aspartoacylase  31.36 
 
 
338 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.645448  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5243  ectoine utilization protein EutE  33.02 
 
 
335 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.472707 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1931  deacylase-like protein  32 
 
 
271 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4379  ectoine utilization protein EutE  36.79 
 
 
333 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>