More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0062 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0062  GTP-binding protein EngA  100 
 
 		 455 aa  924    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  64.68 
 
 		 506 aa  624  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0193  GTP-binding protein EngA  63.03 
 
 		 495 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1477  GTP-binding protein EngA  63.92 
 
 		 454 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0504  GTP-binding protein EngA  50.33 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  47.35 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  42.73 
 
 		 494 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  42.95 
 
 		 493 aa  340  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  43.68 
 
 		 441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  43.08 
 
 		 441 aa  336  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  40.59 
 
 		 440 aa  336  5e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  39.96 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.73 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  40.04 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  41.08 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  41.15 
 
 		 439 aa  326  6e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  39.71 
 
 		 495 aa  325  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  40.86 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  38.61 
 
 		 455 aa  322  7e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  39.37 
 
 		 440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  38.53 
 
 		 442 aa  320  5e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  40.84 
 
 		 448 aa  319  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  39.82 
 
 		 464 aa  319  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  40.58 
 
 		 446 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1614  GTP-binding protein EngA  40.09 
 
 		 499 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106208 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3492  small GTP-binding protein  39.34 
 
 		 473 aa  316  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166224 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  40.48 
 
 		 449 aa  316  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  37.12 
 
 		 455 aa  315  7e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  37.86 
 
 		 441 aa  315  8e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  41.1 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  39.22 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  39.22 
 
 		 452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  39.74 
 
 		 440 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  41.69 
 
 		 444 aa  314  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1458  GTP-binding protein EngA  38.44 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000548717  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  38.08 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  39.6 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  39.6 
 
 		 438 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  40.87 
 
 		 467 aa  313  4.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  38.33 
 
 		 453 aa  312  7.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004345  GTP-binding protein EngA  39.51 
 
 		 498 aa  312  9e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  39.09 
 
 		 498 aa  312  9e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  40.32 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  37.72 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1075  small GTP-binding protein  39.29 
 
 		 438 aa  311  2e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  40.44 
 
 		 434 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  38.93 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  38.93 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  38.93 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  38.93 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  38.93 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  38.93 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  38.93 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  38.93 
 
 		 436 aa  309  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  38.02 
 
 		 454 aa  310  5e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  40.67 
 
 		 439 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  38.7 
 
 		 436 aa  309  8e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  38.48 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  38.82 
 
 		 443 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0598  GTP-binding protein EngA  39.47 
 
 		 469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  39.51 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  38.26 
 
 		 436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  37.87 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  38.12 
 
 		 443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  40.62 
 
 		 456 aa  307  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  39.64 
 
 		 442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2886  GTP-binding protein EngA  37.71 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000684219  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0387  GTP-binding protein EngA  37.97 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  38.84 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  38.93 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  38.08 
 
 		 445 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  38.38 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  38.93 
 
 		 449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  36.24 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0893  GTP-binding protein EngA  38.44 
 
 		 427 aa  305  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177025  hitchhiker  0.0000000000000146029 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02403  GTP-binding protein EngA  37.71 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000560332  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1157  small GTP-binding protein  37.71 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  39.51 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2663  GTP-binding protein EngA  37.71 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194974 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2795  GTP-binding protein EngA  37.71 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000215643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2662  GTP-binding protein EngA  37.71 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000307508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3735  GTP-binding protein EngA  37.71 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0134821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1166  GTP-binding protein EngA  37.71 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000585661  normal  0.0127623 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02365  hypothetical protein  37.71 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00134909  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  38.25 
 
 		 481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  37.25 
 
 		 461 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  36.03 
 
 		 456 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  37.94 
 
 		 471 aa  303  5.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1992  GTP-binding protein EngA  37.5 
 
 		 446 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.916192  normal  0.0223311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2713  GTP-binding protein EngA  37.82 
 
 		 490 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  38.34 
 
 		 439 aa  302  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1428  GTP-binding protein EngA  38.84 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0495777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  39.52 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  41.37 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2126  GTP-binding protein EngA  39.47 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.127058  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  38.38 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1532  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44322  predicted protein  40.04 
 
 		 555 aa  301  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00480829  normal  0.0297324 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1562  GTP-binding protein EngA  40 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.496113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  38.46 
 
 		 494 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>