More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0022 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0022  ATPase  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2298  ATPase  56.45 
 
 
273 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1817  ABC transporter related  56.79 
 
 
274 aa  270  1e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0472  ABC transporter related  51.79 
 
 
293 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0139008  hitchhiker  0.0000833455 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0853  ABC transporter related  56.61 
 
 
273 aa  263  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0785068 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3704  ABC transporter related  48.18 
 
 
265 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307132  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0535  ABC transporter related  50.63 
 
 
271 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2449  ABC transporter related  44.13 
 
 
268 aa  228  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0716  ABC transporter related  44.94 
 
 
286 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0748  ABC transporter related  44.44 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1013  ABC transporter-related protein  43.9 
 
 
306 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0401  ABC transporter related  47 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186175  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0379  ABC transporter related  40 
 
 
262 aa  216  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3259  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2413  ABC transporter related  43.98 
 
 
266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0317  ABC transporter related  45.42 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0527891  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2750  ABC-type transport system, ATPase component  46.28 
 
 
265 aa  211  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0393  ABC transporter related  45.42 
 
 
273 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.261527  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3512  ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
273 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317493  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2693  ABC transporter related  45.42 
 
 
273 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0414  ABC transporter related  45.42 
 
 
273 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0685  ABC transporter related  42.06 
 
 
293 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1154  ABC transporter related  42.21 
 
 
286 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2935  ABC transporter related  42.74 
 
 
271 aa  209  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0386  ABC transporter related protein  44.13 
 
 
277 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2909  ABC transporter component  45.06 
 
 
277 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2415  ABC transporter related  43.72 
 
 
264 aa  208  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2397  ABC transporter related  44.96 
 
 
277 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3004  ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 
272 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0387  ABC transporter, ATPase subunit, toluene tolerance Ttg2A-like  45.2 
 
 
273 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3402  ABC transporter related  41.53 
 
 
270 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2770  ABC transporter related  45.45 
 
 
273 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1057  ABC transporter related  48.11 
 
 
298 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.184914  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0096  ABC transporter related  42.62 
 
 
282 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.568034  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3571  ABC transporter related  45.2 
 
 
273 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626203  hitchhiker  0.0000199293 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1495  ABC transporter related  47.11 
 
 
267 aa  205  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00076856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0248  ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 
255 aa  205  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1887  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
296 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0341  ABC transporter related  43.82 
 
 
273 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0095  ABC transporter related  41.98 
 
 
283 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000937702  normal  0.953414 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0332  ABC transporter related  43.82 
 
 
273 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2513  ABC transporter related  43.72 
 
 
259 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0824022  normal  0.0374707 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1777  ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
272 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2726  ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
272 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3704  putative ABC transporter ATP-binding subunit  44.77 
 
 
272 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2776  ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
272 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.849481  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3677  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
272 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0124064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3228  ABC transporter, ATP-binding protein  44.77 
 
 
272 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3122  ABC transporter related  42.8 
 
 
273 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.701707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5536  ABC transporter related  42.26 
 
 
309 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0793  ABC transporter related  41.04 
 
 
282 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.215167  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1074  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents ATPase component-like protein  42.08 
 
 
333 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3735  toluene tolerance ABC transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
272 aa  201  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527515  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1712  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 
252 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000576973 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0979  ABC transporter related  43.16 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2636  ABC transporter related  43.15 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0997  ABC transporter related  43.72 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0677  ABC transporter related  40.82 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1621  ABC transporter related protein  42.19 
 
 
363 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.966929  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3394  ABC transporter-related protein  42.04 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0958  toluene tolerance ABC efflux transporter, ATP-binding protein  43.72 
 
 
269 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0863  ABC transporter-like  44.26 
 
 
270 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.535463  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2962  ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3137  ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.297163  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1229  ABC transporter related  49.06 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.380088  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0855  ABC transporter related protein  43.24 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.795905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0039  ABC transporter related  42.15 
 
 
302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4349  ABC transporter related protein  40.42 
 
 
359 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0328  ABC transporter related  42.44 
 
 
249 aa  198  5e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.673492  normal  0.624259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12850  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, ATP binding component  42.39 
 
 
269 aa  198  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0965  ABC transporter related  43.72 
 
 
269 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4257  ABC transporter related  43.72 
 
 
269 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2446  ABC transporter component  46.58 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.404334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0816  ABC transporter, ATP-binding protein  42.37 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0669  ABC transporter related  44.98 
 
 
254 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0700  ABC transporter related  41.35 
 
 
333 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1073  ABC transporter related  41.46 
 
 
258 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3101  putative ABC transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 
279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10668  ribonucleotide transport ATP-binding protein ABC transporter mkl  42.5 
 
 
359 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.139977  normal  0.579373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1040  ABC transporter related  43.22 
 
 
248 aa  195  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0561  ABC transporter related  43.22 
 
 
248 aa  194  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000384868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1969  ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 
275 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.309748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6635  ABC transporter related  44 
 
 
363 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 
264 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5028  ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 
269 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1488  ABC transporter related  44.74 
 
 
257 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2893  ABC transporter related  41.27 
 
 
277 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.267676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3240  ABC transporter related  41.27 
 
 
277 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.738413  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4141  ABC transporter  43.03 
 
 
269 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1900  ABC transporter ATPase  41.3 
 
 
270 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.81319  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2810  ABC transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 
257 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0787  ABC transporter-related protein  42.37 
 
 
248 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0467  ABC transporter related  43.48 
 
 
253 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57880  ABC transporter ATP-binding protein  41.87 
 
 
269 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0759  ABC transporter related protein  42.17 
 
 
289 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1984  ATPase  41.8 
 
 
257 aa  192  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.101107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1611  ABC transporter related  48.48 
 
 
295 aa  193  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1719  ABC transporter related  45.61 
 
 
257 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0483086  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4624  ABC transporter related  42.62 
 
 
258 aa  192  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>