More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0011 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 417 aa  856    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  71.22 
 
 		 417 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  71.5 
 
 		 426 aa  587  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  62.59 
 
 		 417 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  60.88 
 
 		 419 aa  511  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  61.14 
 
 		 416 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 		 419 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 419 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 421 aa  418  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 		 415 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 		 421 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 421 aa  368  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 420 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 420 aa  365  1e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 415 aa  363  2e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 423 aa  363  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 423 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  47.47 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 424 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 		 424 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 414 aa  362  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 419 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 424 aa  359  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  45.32 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 414 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 414 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 429 aa  353  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 422 aa  352  8e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 421 aa  351  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 424 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 426 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  45.41 
 
 		 423 aa  348  9e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 406 aa  348  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 422 aa  345  6e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 424 aa  345  8.999999999999999e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 422 aa  344  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2590  histidyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 422 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108947  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 423 aa  343  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 424 aa  342  5e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 411 aa  343  5e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 423 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  45.21 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 420 aa  338  8e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  43.7 
 
 		 421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 423 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 		 420 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 415 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 415 aa  332  9e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 426 aa  331  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 415 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 440 aa  330  2e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 424 aa  329  4e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 421 aa  328  9e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>