More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3907 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2505  extracellular solute-binding protein family 5  67.11 
 
 
531 aa  772  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  82.06 
 
 
535 aa  941  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  83.46 
 
 
526 aa  941  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0044  extracellular solute-binding protein family 5  87.29 
 
 
535 aa  996  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  93.83 
 
 
535 aa  1059  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  81.87 
 
 
535 aa  941  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  63.4 
 
 
530 aa  709  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  60.47 
 
 
531 aa  651  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  82.06 
 
 
535 aa  938  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  60.9 
 
 
532 aa  654  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2356  extracellular solute-binding protein  65.25 
 
 
529 aa  701  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  66.6 
 
 
506 aa  734  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  82.24 
 
 
535 aa  941  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
535 aa  1112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0399  extracellular solute-binding protein family 5  59.38 
 
 
546 aa  644  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  61.02 
 
 
532 aa  655  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  83.46 
 
 
526 aa  941  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  82.24 
 
 
535 aa  941  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  83.65 
 
 
526 aa  944  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2930  extracellular solute-binding protein family 5  66.35 
 
 
531 aa  758  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  82.24 
 
 
535 aa  941  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  82.24 
 
 
535 aa  941  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  81.87 
 
 
535 aa  941  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  87.66 
 
 
535 aa  999  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  67.74 
 
 
531 aa  782  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  84.11 
 
 
535 aa  958  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  82.24 
 
 
535 aa  941  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  82.24 
 
 
535 aa  941  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0088  4-phytase  81.87 
 
 
535 aa  941  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  82.24 
 
 
535 aa  941  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1531  extracellular solute-binding protein family 5  67.3 
 
 
531 aa  763  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  83.27 
 
 
526 aa  939  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  83.46 
 
 
526 aa  941  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2411  extracellular solute-binding protein family 5  67.59 
 
 
531 aa  750  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334082  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3754  extracellular solute-binding protein family 5  57.22 
 
 
542 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.884226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  58.24 
 
 
545 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0182  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  56.85 
 
 
542 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  57.34 
 
 
543 aa  626  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0885  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  55.08 
 
 
541 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.575043  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0924  extracellular solute-binding protein  55.25 
 
 
541 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4293  extracellular solute-binding protein  55.43 
 
 
541 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.5263  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0256  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  58.08 
 
 
542 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0243  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein DppA  58.08 
 
 
542 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58350  putative binding protein component of ABC transpor  54.39 
 
 
537 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1949  extracellular solute-binding protein  58.38 
 
 
542 aa  617  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0969647  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0437  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  58.08 
 
 
574 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.217985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0220  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  58.08 
 
 
542 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63568  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5110  ABC transporter periplasmic binding protein  54.21 
 
 
537 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.321263  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4558  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  56.27 
 
 
540 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.44901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3378  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  57.69 
 
 
542 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3301  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  57.69 
 
 
542 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2969  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  57.69 
 
 
542 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2121  dipeptide ABC transporter, periplasmic didpeptide-binding protein  57.69 
 
 
536 aa  613  1e-174  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443402  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3231  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  56.86 
 
 
532 aa  612  1e-174  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.704667  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3969  extracellular solute-binding protein  56.86 
 
 
532 aa  612  1e-174  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0928  extracellular solute-binding protein  54.34 
 
 
541 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  56.64 
 
 
538 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3040  extracellular solute-binding protein  57.25 
 
 
542 aa  607  1e-172  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.607327 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0181  ABC dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  55.8 
 
 
547 aa  605  1e-172  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2431  extracellular solute-binding protein  56.87 
 
 
542 aa  607  1e-172  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4235  extracellular solute-binding protein  55.17 
 
 
542 aa  605  1e-172  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3064  extracellular solute-binding protein  56.87 
 
 
542 aa  607  1e-172  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.150422 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3045  extracellular solute-binding protein  56.87 
 
 
542 aa  607  1e-172  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3090  extracellular solute-binding protein  56.3 
 
 
542 aa  602  1e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5114  ABC transporter periplasmic binding protein  55.3 
 
 
533 aa  602  1e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0841  extracellular solute-binding protein  55.53 
 
 
531 aa  602  1e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  54.91 
 
 
547 aa  602  1e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2956  extracellular solute-binding protein  56.49 
 
 
542 aa  604  1e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6392  ABC oligopeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  57.06 
 
 
542 aa  603  1e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  55.8 
 
 
533 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  53.66 
 
 
547 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4236  extracellular solute-binding protein  55.01 
 
 
530 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.978762  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0845  extracellular solute-binding protein  54.8 
 
 
532 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0329  extracellular solute-binding protein  54.37 
 
 
531 aa  588  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.0616043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0067  extracellular solute-binding protein  53.7 
 
 
542 aa  587  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  55.45 
 
 
532 aa  583  1e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4557  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  54.71 
 
 
535 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4559  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  53.12 
 
 
530 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0816  extracellular solute-binding protein  52.46 
 
 
533 aa  579  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0973  extracellular solute-binding protein  56.05 
 
 
532 aa  578  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4234  extracellular solute-binding protein  54.71 
 
 
535 aa  578  1e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0390  extracellular solute-binding protein family 5  53.58 
 
 
531 aa  572  1e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18086  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0815  extracellular solute-binding protein  53.1 
 
 
532 aa  572  1e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0422  extracellular solute-binding protein family 5  53.4 
 
 
531 aa  574  1e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00166095  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1582  extracellular solute-binding protein  53.4 
 
 
531 aa  569  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0923  extracellular solute-binding protein  53.05 
 
 
530 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0759  extracellular solute-binding protein  54.81 
 
 
547 aa  566  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0884  dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  52.1 
 
 
530 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0511525  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1526  extracellular solute-binding protein  54.33 
 
 
544 aa  560  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4294  extracellular solute-binding protein  51.31 
 
 
530 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.502669  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0927  extracellular solute-binding protein  52.67 
 
 
530 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4405  extracellular solute-binding protein  51.89 
 
 
532 aa  554  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3508  extracellular solute-binding protein  51.76 
 
 
553 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3923  extracellular solute-binding protein  51.74 
 
 
528 aa  525  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333304  normal  0.449349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  51.08 
 
 
531 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4350  extracellular solute-binding protein  51.56 
 
 
553 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.801154  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  48.01 
 
 
589 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4016  extracellular solute-binding protein  51.56 
 
 
553 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3416  extracellular solute-binding protein  51.94 
 
 
528 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.680015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4568  extracellular solute-binding protein  51.18 
 
 
553 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>