75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3835 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3835  protein of unknown function DUF955  100 
 
 		 370 aa  764    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0188  hypothetical protein  42.59 
 
 		 383 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138963  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0104  helix-turn-helix domain-containing protein  32.95 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0634562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  31.88 
 
 		 372 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  33.03 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  31.59 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  32.19 
 
 		 366 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  30.23 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  32.74 
 
 		 372 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  33.33 
 
 		 355 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  31.27 
 
 		 356 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  29.15 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  29.05 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3976  hypothetical protein  29.05 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14662  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3866  protein of unknown function DUF955  31.99 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000000210124  normal  0.0502715 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  28.48 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  31.49 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  28.49 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  28.05 
 
 		 359 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4968  helix-turn-helix domain-containing protein  30.31 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0119707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  30.2 
 
 		 354 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  30.48 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  34.23 
 
 		 349 aa  104  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  30.41 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1489  hypothetical protein  26.53 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0715409  decreased coverage  0.000118566 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  30.75 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  30.91 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  30.07 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  30.17 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  27.85 
 
 		 346 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  31.21 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6282  helix-turn-helix domain-containing protein  29.34 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6257  helix-turn-helix domain protein  30.8 
 
 		 351 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1622  putative DNA-binding protein  25.6 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139864  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2694  protein of unknown function DUF955  28.48 
 
 		 360 aa  89.4  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00279069  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  25.73 
 
 		 362 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  24.87 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  24.87 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  27 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  28.03 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  29.32 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2984  helix-turn-helix domain protein  25.62 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0858456  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  28.05 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2790  helix-turn-helix domain protein  26.8 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.783266 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1425  hypothetical protein  27.87 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  32.05 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  26.79 
 
 		 169 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  27.71 
 
 		 273 aa  53.1  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  26.4 
 
 		 294 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  32.94 
 
 		 182 aa  52.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  24.92 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  28.24 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  24.85 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  33.86 
 
 		 188 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  27.68 
 
 		 173 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  25.55 
 
 		 170 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  35.35 
 
 		 270 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  27.5 
 
 		 370 aa  47.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4294  XRE family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 510 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  32.5 
 
 		 175 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4239  transcriptional regulator, XRE family  23.73 
 
 		 510 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  24.85 
 
 		 255 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4434  XRE family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 509 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0106  XRE family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 509 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  22.34 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0680  XRE family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 504 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  30.17 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  27.06 
 
 		 174 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  24.4 
 
 		 272 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  33.96 
 
 		 156 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  39.39 
 
 		 289 aa  43.1  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  38.81 
 
 		 165 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3866  XRE family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 509 aa  42.7  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  38.18 
 
 		 147 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>