More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3783 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  55.59 
 
 		 631 aa  677    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  65.81 
 
 		 614 aa  808    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  63.06 
 
 		 630 aa  775    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  65.81 
 
 		 614 aa  808    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  65 
 
 		 614 aa  800    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  65 
 
 		 614 aa  805    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  65 
 
 		 614 aa  799    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  70.02 
 
 		 623 aa  874    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  63.06 
 
 		 630 aa  775    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  65 
 
 		 614 aa  801    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  65 
 
 		 614 aa  800    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  65.29 
 
 		 631 aa  815    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  65.81 
 
 		 614 aa  809    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  65.81 
 
 		 614 aa  810    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  67.68 
 
 		 615 aa  847    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  65.65 
 
 		 614 aa  806    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  100 
 
 		 615 aa  1253    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  65.16 
 
 		 614 aa  802    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  50.87 
 
 		 631 aa  622  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  50.55 
 
 		 631 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  39.09 
 
 		 611 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  38.14 
 
 		 611 aa  362  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  35.01 
 
 		 618 aa  333  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  33.7 
 
 		 617 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 613 aa  263  4.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 616 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.72 
 
 		 613 aa  249  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.45 
 
 		 616 aa  244  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.4 
 
 		 619 aa  242  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  29.28 
 
 		 628 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  31.42 
 
 		 617 aa  239  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 617 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  28.78 
 
 		 616 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 648 aa  230  7e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 614 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 627 aa  228  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  30.32 
 
 		 1023 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 619 aa  227  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 593 aa  226  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  28.07 
 
 		 628 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  29.38 
 
 		 615 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  29.69 
 
 		 614 aa  221  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  28.82 
 
 		 622 aa  217  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 624 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 		 612 aa  210  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  29.55 
 
 		 646 aa  209  9e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 627 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  29.61 
 
 		 685 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 602 aa  205  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  29.34 
 
 		 627 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  29.61 
 
 		 685 aa  205  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  29.61 
 
 		 685 aa  205  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  29.61 
 
 		 685 aa  205  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 641 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  29.37 
 
 		 628 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  30.08 
 
 		 821 aa  203  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 632 aa  203  9e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  29.44 
 
 		 685 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  29.44 
 
 		 685 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 624 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.87 
 
 		 630 aa  201  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 626 aa  201  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 627 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  27.88 
 
 		 613 aa  201  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  30.19 
 
 		 680 aa  200  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  29.49 
 
 		 638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 624 aa  199  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  28.35 
 
 		 623 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 673 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 626 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  27.53 
 
 		 645 aa  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 642 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4173  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 638 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.422037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 690 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 634 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  27.65 
 
 		 623 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 637 aa  190  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 617 aa  189  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 602 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 		 671 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  27.43 
 
 		 621 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 698 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1485  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 735 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.22369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  27 
 
 		 623 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 638 aa  183  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 634 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 641 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 642 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 642 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 642 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 618 aa  179  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 629 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 692 aa  177  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 670 aa  176  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4347  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 642 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  27.94 
 
 		 650 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 634 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  27.94 
 
 		 650 aa  174  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  27.65 
 
 		 650 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  27.79 
 
 		 650 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>