More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3726 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  71.91 
 
 		 476 aa  711    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  65.68 
 
 		 474 aa  660    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 479 aa  991    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  65.74 
 
 		 478 aa  661    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  63.3 
 
 		 471 aa  622  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  60.09 
 
 		 470 aa  597  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  59.87 
 
 		 470 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  59.87 
 
 		 470 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  59.87 
 
 		 470 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  59.87 
 
 		 470 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1440  transcriptional regulator  56.78 
 
 		 482 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  58.96 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 473 aa  567  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  58.46 
 
 		 471 aa  568  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5185  GntR family transcriptional regulator  58.32 
 
 		 496 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0411857 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5275  GntR family transcriptional regulator  58.1 
 
 		 496 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.187277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  58.53 
 
 		 496 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  58.75 
 
 		 474 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  58.75 
 
 		 476 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  57.08 
 
 		 473 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  55.32 
 
 		 473 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 473 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 504 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 475 aa  360  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1582  transcriptional regulator  40.46 
 
 		 483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 479 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  38.74 
 
 		 479 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  39.48 
 
 		 479 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 479 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 478 aa  349  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 502 aa  349  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  41.42 
 
 		 473 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  39.48 
 
 		 479 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 532 aa  346  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  40.65 
 
 		 473 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 480 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 478 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 509 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 530 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 483 aa  341  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 473 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 472 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 472 aa  340  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 472 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 479 aa  339  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1067  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 478 aa  339  7e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 487 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  38.56 
 
 		 469 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  40.3 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 471 aa  336  7e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 474 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 473 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 473 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 473 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.64 
 
 		 475 aa  329  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 477 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 478 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.72 
 
 		 475 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10530  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  38.51 
 
 		 472 aa  326  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2230  GntR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 469 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  38.79 
 
 		 500 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 469 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3581  transcriptional regulator  39.08 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634992  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.64 
 
 		 470 aa  323  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 470 aa  323  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.37 
 
 		 477 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.19 
 
 		 492 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3939  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 482 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.98 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  36.83 
 
 		 475 aa  319  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.14 
 
 		 487 aa  319  7.999999999999999e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.08 
 
 		 479 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  37.53 
 
 		 477 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3442  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 481 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0677812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4517  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.95 
 
 		 471 aa  316  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3095  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 491 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5393  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0156586 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3927  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 477 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.510298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  36.83 
 
 		 475 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7058  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 474 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.62 
 
 		 479 aa  313  5.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1356  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 477 aa  312  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1432  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.422672  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6397  GntR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 474 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  38.69 
 
 		 477 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6453  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610703 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5696  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 475 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5419  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.454828  normal  0.125674 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6954  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 474 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.273802  normal  0.898059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6020  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 474 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.492916  normal  0.125321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  38.4 
 
 		 481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>