More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3686 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  72.26 
 
 
483 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  72.26 
 
 
483 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  72.26 
 
 
483 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  77.33 
 
 
484 aa  720    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  78.24 
 
 
481 aa  732    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  77.33 
 
 
484 aa  720    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  73.08 
 
 
483 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  72.26 
 
 
483 aa  691    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  77.33 
 
 
484 aa  720    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  73.08 
 
 
483 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  72.26 
 
 
483 aa  691    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  72.26 
 
 
483 aa  691    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  74.84 
 
 
483 aa  719    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  73.29 
 
 
483 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  73.5 
 
 
483 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  82.99 
 
 
483 aa  739    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  72.26 
 
 
483 aa  691    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  82.99 
 
 
483 aa  738    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 
483 aa  949    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  89.83 
 
 
483 aa  832    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  72.26 
 
 
483 aa  691    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  72.26 
 
 
483 aa  698    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  73.29 
 
 
483 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  57.14 
 
 
480 aa  537  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  52.9 
 
 
492 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  50.94 
 
 
495 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  50.66 
 
 
494 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  47.13 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  46.55 
 
 
487 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  46.71 
 
 
477 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  46.71 
 
 
477 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  47.13 
 
 
477 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  46.71 
 
 
477 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  46.5 
 
 
479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  46.5 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  46.5 
 
 
479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  46.5 
 
 
479 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  46.5 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  42.58 
 
 
482 aa  402  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  46.49 
 
 
477 aa  395  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  44.75 
 
 
481 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  41.91 
 
 
483 aa  362  6e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  43.96 
 
 
479 aa  359  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  38.08 
 
 
512 aa  317  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  38.19 
 
 
496 aa  315  9e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  37.98 
 
 
540 aa  303  6.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  31.75 
 
 
444 aa  224  2e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.19 
 
 
504 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  26.83 
 
 
492 aa  150  5e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.31 
 
 
533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  27.82 
 
 
529 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  28.09 
 
 
492 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  26.79 
 
 
492 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  26.79 
 
 
492 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  26.79 
 
 
492 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  27.72 
 
 
493 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  27.72 
 
 
487 aa  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  26.79 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  27.72 
 
 
493 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  27.72 
 
 
493 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.45 
 
 
492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  26.58 
 
 
492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  26.58 
 
 
492 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.02 
 
 
492 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  28.1 
 
 
482 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  25.91 
 
 
493 aa  138  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.02 
 
 
492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  28.21 
 
 
518 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  27.02 
 
 
492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.74 
 
 
492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.02 
 
 
492 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.02 
 
 
492 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.02 
 
 
492 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  28.3 
 
 
511 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.81 
 
 
492 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  28.21 
 
 
497 aa  136  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26 
 
 
533 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  26.87 
 
 
492 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  25.62 
 
 
508 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  24.9 
 
 
489 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  25.1 
 
 
489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  27.95 
 
 
495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  26.39 
 
 
528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.03 
 
 
533 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  25.96 
 
 
491 aa  134  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.65 
 
 
504 aa  134  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.62 
 
 
484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  25.38 
 
 
489 aa  133  6e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.57 
 
 
485 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  27.19 
 
 
488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.82 
 
 
513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  27.44 
 
 
495 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  28.48 
 
 
512 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  28.48 
 
 
512 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  27.8 
 
 
498 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  25.63 
 
 
527 aa  128  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  24.9 
 
 
488 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  27.33 
 
 
537 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  24.42 
 
 
544 aa  126  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>