More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3523 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  100 
 
 
355 aa  698    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  94.08 
 
 
355 aa  638    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  56.16 
 
 
354 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  56.67 
 
 
355 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4657  Monosaccharide-transporting ATPase  55.76 
 
 
354 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.629166 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3767  monosaccharide-transporting ATPase  58.38 
 
 
354 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4756  inner-membrane translocator  56.06 
 
 
354 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0208459  normal  0.704824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  54.98 
 
 
365 aa  339  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3250  ribose ABC transporter, permease protein  56.33 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3384  monosaccharide-transporting ATPase  56.02 
 
 
381 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0912  ribose ABC transporter permease  56.02 
 
 
381 aa  327  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  50 
 
 
346 aa  292  5e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  49.69 
 
 
346 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  48.92 
 
 
350 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  49.1 
 
 
365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  50.62 
 
 
353 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  50.31 
 
 
353 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  46.88 
 
 
383 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  42.55 
 
 
324 aa  245  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  42.86 
 
 
350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  41.57 
 
 
322 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  40.54 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  40.54 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  40.54 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  40.54 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  40.54 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3976  ribose ABC transporter permease protein  40.18 
 
 
322 aa  232  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.144441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  39.76 
 
 
321 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4114  ribose ABC transporter permease protein  40.84 
 
 
321 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32727  normal  0.0391743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  40.49 
 
 
321 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  40.49 
 
 
321 aa  231  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  40.49 
 
 
321 aa  231  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  40.49 
 
 
321 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  40.49 
 
 
321 aa  231  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  40.49 
 
 
321 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  40.49 
 
 
321 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  40.49 
 
 
321 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  41.46 
 
 
322 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4173  ribose ABC transporter permease protein  40 
 
 
322 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00211847  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  41.57 
 
 
322 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  39.14 
 
 
327 aa  226  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  39.14 
 
 
327 aa  225  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  40.24 
 
 
324 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  40.75 
 
 
323 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  42.55 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  40.25 
 
 
324 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  41.72 
 
 
312 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  39.14 
 
 
330 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.49 
 
 
345 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  39.14 
 
 
330 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  39.14 
 
 
330 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  39.31 
 
 
346 aa  212  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  40.8 
 
 
345 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  39.08 
 
 
325 aa  210  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  37.5 
 
 
317 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  40.68 
 
 
318 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  38.17 
 
 
311 aa  209  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  38.76 
 
 
345 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  38.76 
 
 
345 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  38.76 
 
 
345 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  41.38 
 
 
347 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  41.99 
 
 
314 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  40.18 
 
 
330 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  40.18 
 
 
330 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  40.18 
 
 
330 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  40.53 
 
 
331 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  39.75 
 
 
345 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  41.8 
 
 
340 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  41.69 
 
 
315 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
311 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
311 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
311 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.58 
 
 
311 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.58 
 
 
311 aa  203  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
311 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
311 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 
311 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  38.85 
 
 
311 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.26 
 
 
311 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  41.9 
 
 
835 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.26 
 
 
311 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  41.59 
 
 
310 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  41.59 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.99 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  38.63 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  39.01 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  40.37 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  39.39 
 
 
342 aa  200  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  41.48 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  39.39 
 
 
342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  41.48 
 
 
345 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  41.48 
 
 
345 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  39.39 
 
 
334 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  42.68 
 
 
341 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  39.81 
 
 
348 aa  199  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  39.32 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  40.37 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  40.37 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  36.78 
 
 
331 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  39.46 
 
 
338 aa  197  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>