164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3512 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
453 aa  912    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  59.65 
 
 
450 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  55.68 
 
 
458 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  55 
 
 
458 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  49.77 
 
 
486 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  35.35 
 
 
451 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  34.43 
 
 
450 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  30.68 
 
 
456 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  33.72 
 
 
450 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  32.06 
 
 
455 aa  180  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  29.37 
 
 
446 aa  179  8e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  28.63 
 
 
449 aa  179  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  29.33 
 
 
446 aa  171  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  31.59 
 
 
488 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  32.5 
 
 
483 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  29.15 
 
 
446 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  35.14 
 
 
463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  35.14 
 
 
464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  32.67 
 
 
460 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  32.29 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  34.61 
 
 
461 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  31.82 
 
 
457 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  32.27 
 
 
481 aa  161  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  31 
 
 
468 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 
501 aa  160  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  27.62 
 
 
481 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  30.38 
 
 
459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  31.82 
 
 
449 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  34.95 
 
 
468 aa  156  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  31.7 
 
 
454 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  29.4 
 
 
441 aa  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  31.59 
 
 
471 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  29.14 
 
 
490 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  29.26 
 
 
449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  33.56 
 
 
464 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  32.87 
 
 
462 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  31.84 
 
 
454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  32.49 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  32.66 
 
 
445 aa  146  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  30.65 
 
 
470 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  28.74 
 
 
441 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  32.6 
 
 
453 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  30.84 
 
 
470 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  27.7 
 
 
457 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  30.84 
 
 
458 aa  144  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  29.49 
 
 
460 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  33.93 
 
 
462 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  30.57 
 
 
463 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  31.2 
 
 
457 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  32.36 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  32.41 
 
 
451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  35.01 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  31.5 
 
 
463 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  33.57 
 
 
494 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  33.26 
 
 
462 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  30.56 
 
 
458 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  33.64 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  30.53 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  36.26 
 
 
447 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  33.64 
 
 
454 aa  134  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  28.36 
 
 
481 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  31.67 
 
 
455 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  33.57 
 
 
454 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  32.81 
 
 
464 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  28.29 
 
 
453 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  28.76 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  30.11 
 
 
456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  32.48 
 
 
476 aa  127  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  29.27 
 
 
476 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  33.1 
 
 
461 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  28.92 
 
 
450 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  31.05 
 
 
451 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  30.71 
 
 
451 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  28.27 
 
 
449 aa  123  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  29.35 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  31.87 
 
 
500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  31.25 
 
 
451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  26.39 
 
 
472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  29.82 
 
 
482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  27.66 
 
 
453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  26.97 
 
 
453 aa  120  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  29.27 
 
 
450 aa  120  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  33.88 
 
 
454 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  25.94 
 
 
504 aa  119  9e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  31.1 
 
 
461 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7308  MmgE/PrpD  28.33 
 
 
504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  32.63 
 
 
462 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  29.35 
 
 
458 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  31.45 
 
 
472 aa  117  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  31.2 
 
 
456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  30.19 
 
 
451 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  28.35 
 
 
485 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  28.73 
 
 
460 aa  113  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  29.5 
 
 
461 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  31.75 
 
 
465 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  31.42 
 
 
482 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  27.86 
 
 
453 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1106  MmgE/PrpD family protein  32.76 
 
 
359 aa  108  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  30.43 
 
 
503 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>