More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3316 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3438  L-1,2-propanediol oxidoreductase  87.21 
 
 
383 aa  692    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0837  L-1,2-propanediol oxidoreductase  81.72 
 
 
383 aa  654    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0621  L-1,2-propanediol oxidoreductase  82.25 
 
 
383 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3316  L-1,2-propanediol oxidoreductase  100 
 
 
383 aa  783    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  72.06 
 
 
383 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0889  lactaldehyde reductase  72.06 
 
 
382 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  71.8 
 
 
383 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3104  L-1,2-propanediol oxidoreductase  72.06 
 
 
382 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.189679  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  71.8 
 
 
383 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  71.8 
 
 
382 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  71.54 
 
 
383 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  71.54 
 
 
383 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3196  L-1,2-propanediol oxidoreductase  71.54 
 
 
382 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3116  L-1,2-propanediol oxidoreductase  71.84 
 
 
382 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.303713  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3133  L-1,2-propanediol oxidoreductase  71.84 
 
 
382 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.183731 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3296  L-1,2-propanediol oxidoreductase  71.84 
 
 
382 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3181  L-1,2-propanediol oxidoreductase  71.02 
 
 
382 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292144  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  61.36 
 
 
382 aa  488  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1046  L-1,2-propanediol oxidoreductase  60.84 
 
 
382 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.968246  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1839  L-1,2-propanediol oxidoreductase  55.35 
 
 
383 aa  441  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2495  lactaldehyde reductase  56.43 
 
 
382 aa  442  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.14 
 
 
384 aa  347  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001472  alcohol dehydrogenase  42.41 
 
 
382 aa  305  7e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  40.52 
 
 
382 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1935  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.78 
 
 
389 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.97 
 
 
383 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.36 
 
 
382 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  41.36 
 
 
382 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2865  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.73 
 
 
402 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.452469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 
382 aa  297  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 
383 aa  296  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
382 aa  294  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05412  alcohol dehydrogenase  41.88 
 
 
382 aa  292  5e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.12 
 
 
382 aa  292  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.94 
 
 
382 aa  292  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.99 
 
 
382 aa  292  8e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.58 
 
 
382 aa  291  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3881  putative alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 
383 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.656284  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  40.94 
 
 
382 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  42.01 
 
 
382 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1788  alcohol dehydrogenase 2  42.47 
 
 
381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.51 
 
 
383 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1851  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.21 
 
 
383 aa  289  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  44.88 
 
 
382 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  44.62 
 
 
382 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0746  lactaldehyde reductase  44.36 
 
 
382 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0727941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4074  lactaldehyde reductase  43.57 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2578  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1152  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.305094  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
382 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
382 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
382 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.47 
 
 
382 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
383 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
383 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  41.36 
 
 
382 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.48 
 
 
382 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  43.38 
 
 
383 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
383 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
383 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
383 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
383 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 
382 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 
382 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  43.38 
 
 
383 aa  279  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4160  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.13 
 
 
383 aa  279  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 
382 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.94 
 
 
382 aa  278  8e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4004  putative alcohol dehydrogenase  43.1 
 
 
383 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.78 
 
 
383 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1398  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.59 
 
 
383 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145523  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2847  alcohol dehydrogenase, class IV  41.24 
 
 
388 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0142  putative alcohol dehydrogenase  41.24 
 
 
383 aa  276  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.555201  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2962  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.97 
 
 
387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.656985  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4327  lactaldehyde reductase  43.31 
 
 
382 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.238519 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  40.16 
 
 
382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4258  lactaldehyde reductase  43.31 
 
 
382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4373  lactaldehyde reductase  43.31 
 
 
382 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4287  lactaldehyde reductase  43.31 
 
 
382 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4439  lactaldehyde reductase  43.31 
 
 
382 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.38 
 
 
382 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3326  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 
393 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.744277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0514  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.3 
 
 
387 aa  265  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0174269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3439  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.42 
 
 
383 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.928685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4231  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 
383 aa  263  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.995734  hitchhiker  0.000246581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2277  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.27 
 
 
388 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  40.16 
 
 
385 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0164  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.62 
 
 
383 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  39.89 
 
 
385 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.39 
 
 
358 aa  259  5.0000000000000005e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0321  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.79 
 
 
393 aa  256  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.529761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0199  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 
393 aa  255  7e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0825  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.05 
 
 
393 aa  255  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.313783  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  37.8 
 
 
383 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1196  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.34 
 
 
387 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3523  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.26 
 
 
393 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2932  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
387 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0554  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.81 
 
 
387 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 
390 aa  249  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.19 
 
 
390 aa  249  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>