More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3126 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  38.44 
 
 		 1005 aa  648    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  70.45 
 
 		 957 aa  1310    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  76.41 
 
 		 926 aa  1439    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  100 
 
 		 925 aa  1887    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  89.19 
 
 		 925 aa  1660    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  39 
 
 		 1004 aa  657    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  51.14 
 
 		 502 aa  498  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  40.97 
 
 		 597 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  48.19 
 
 		 457 aa  410  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  47.3 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  49.32 
 
 		 598 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  47.31 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  46.29 
 
 		 598 aa  392  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  45.39 
 
 		 598 aa  386  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  39.5 
 
 		 608 aa  380  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  46.74 
 
 		 589 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  44.91 
 
 		 596 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  45.14 
 
 		 596 aa  373  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  44.02 
 
 		 596 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  44.91 
 
 		 596 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  46.19 
 
 		 504 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  43.52 
 
 		 583 aa  364  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  46.05 
 
 		 591 aa  363  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  43.75 
 
 		 596 aa  363  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  42.98 
 
 		 589 aa  352  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  41.08 
 
 		 588 aa  349  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  45.56 
 
 		 593 aa  347  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  45.07 
 
 		 596 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  45.07 
 
 		 596 aa  346  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  45.07 
 
 		 596 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  45.29 
 
 		 596 aa  346  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  45.07 
 
 		 596 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  45.07 
 
 		 596 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  45.07 
 
 		 596 aa  345  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  45.07 
 
 		 597 aa  342  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  44.84 
 
 		 596 aa  342  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  36.08 
 
 		 609 aa  317  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  37.48 
 
 		 599 aa  316  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  41.29 
 
 		 589 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0516  NADH:flavin oxidoreductase  40.17 
 
 		 372 aa  308  2.0000000000000002e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2008  NADH:flavin oxidoreductase  40.5 
 
 		 396 aa  308  4.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  36.33 
 
 		 582 aa  296  9e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  36.59 
 
 		 584 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  37.94 
 
 		 591 aa  292  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1532  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.41 
 
 		 374 aa  291  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  35.79 
 
 		 582 aa  290  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  36.3 
 
 		 586 aa  289  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf867  NADH-dependent flavin oxidoreductase  41.1 
 
 		 367 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  35.71 
 
 		 586 aa  283  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  35.97 
 
 		 582 aa  279  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  35.61 
 
 		 582 aa  271  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  35.61 
 
 		 582 aa  271  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  33.68 
 
 		 637 aa  270  8.999999999999999e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7286  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  40.48 
 
 		 384 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.423648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0493  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.41 
 
 		 368 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00242088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0837  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.67 
 
 		 377 aa  253  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  32.47 
 
 		 616 aa  249  1e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2284  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.8 
 
 		 384 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  36.18 
 
 		 603 aa  244  7e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  38.21 
 
 		 515 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  38.21 
 
 		 515 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.58 
 
 		 616 aa  236  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0325  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  35.95 
 
 		 380 aa  234  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  37.12 
 
 		 515 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0345  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  35.68 
 
 		 380 aa  232  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0352016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  34.06 
 
 		 606 aa  231  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0956  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.67 
 
 		 375 aa  230  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0975  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.67 
 
 		 375 aa  230  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  34.85 
 
 		 605 aa  228  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  29.55 
 
 		 650 aa  224  6e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  32.18 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  32.18 
 
 		 587 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1866  NADH:flavin oxidoreductase  34.88 
 
 		 389 aa  222  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  32.84 
 
 		 517 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0542  Oye family NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.26 
 
 		 375 aa  221  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  31.92 
 
 		 668 aa  219  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  31.81 
 
 		 484 aa  218  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  30.59 
 
 		 627 aa  218  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  34.61 
 
 		 511 aa  217  7e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  32.4 
 
 		 519 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  31.82 
 
 		 519 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  32.68 
 
 		 517 aa  213  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  34.18 
 
 		 561 aa  211  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  30.05 
 
 		 631 aa  209  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  31.6 
 
 		 517 aa  209  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  31.24 
 
 		 519 aa  208  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  31.82 
 
 		 517 aa  207  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  32.75 
 
 		 483 aa  203  9e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45689  fumarate reductase flavoprotein subunit  33.89 
 
 		 478 aa  201  6e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  29.17 
 
 		 635 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  32.9 
 
 		 515 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  30.84 
 
 		 510 aa  197  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  31.88 
 
 		 517 aa  195  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  29.86 
 
 		 659 aa  192  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  32.01 
 
 		 500 aa  187  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0771  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.97 
 
 		 330 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0157719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  30.33 
 
 		 505 aa  182  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.45 
 
 		 493 aa  182  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  31.44 
 
 		 507 aa  181  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  30.79 
 
 		 499 aa  179  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>