More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3088 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3088  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1084 aa  2218    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3097  amino acid adenylation domain protein  35.87 
 
 
1157 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3024  amino acid adenylation domain protein  35.61 
 
 
1157 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2675  amino acid adenylation domain protein  35.39 
 
 
2230 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  33.14 
 
 
1514 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3767  pyochelin synthetase F  40.16 
 
 
1835 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.465683  normal  0.470962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  40.45 
 
 
2706 aa  568  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  35.69 
 
 
3739 aa  566  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  34.82 
 
 
3194 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3766  amino acid adenylation  35.49 
 
 
2350 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.454707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2820  amino acid adenylation domain-containing protein  36.43 
 
 
1734 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  35.95 
 
 
3002 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54920  putative non-ribosomal peptide synthetase  34.69 
 
 
1487 aa  562  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0523722  unclonable  4.46113e-20 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  35.62 
 
 
3021 aa  559  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  35.73 
 
 
2258 aa  555  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  31.82 
 
 
2338 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  31.7 
 
 
2336 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1761  amino acid adenylation domain protein  37.05 
 
 
1837 aa  534  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.361217  normal  0.0352507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  31.55 
 
 
2345 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  32.96 
 
 
3252 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1030  amino acid adenylation domain protein  35.47 
 
 
1845 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63087  normal  0.0425488 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2674  amino acid adenylation domain protein  32.27 
 
 
1862 aa  515  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0622  amino acid adenylation domain protein  35.82 
 
 
1174 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0359  amino acid adenylation domain protein  34.01 
 
 
1131 aa  509  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  34.56 
 
 
2619 aa  509  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2821  amino acid adenylation domain-containing protein  36.31 
 
 
2174 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252099  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0683  nonribosomal peptide synthetase  33.3 
 
 
3293 aa  506  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  32.6 
 
 
3875 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  32.43 
 
 
2896 aa  499  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2806  amino acid adenylation domain-containing protein  35.17 
 
 
1317 aa  495  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54930  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.09 
 
 
1113 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000953001  unclonable  2.81239e-20 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0752  amino acid adenylation domain-containing protein  35.05 
 
 
1897 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2151  pyochelin synthetase  35.16 
 
 
2084 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.332048  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0788  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  35.19 
 
 
2023 aa  493  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5942  amino acid adenylation domain-containing protein  32.81 
 
 
1678 aa  492  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0684  putative pyochelin synthetase  34.85 
 
 
1888 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1335  amino acid adenylation domain protein  33.46 
 
 
1104 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1029  amino acid adenylation domain protein  34.54 
 
 
2310 aa  489  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0131723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  36.04 
 
 
4165 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0875  pyochelin synthetase  34.97 
 
 
1809 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0878  putative siderophore non-ribosomal peptide synthase  35.09 
 
 
2090 aa  483  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1827  pyochelin synthetase  34.92 
 
 
1894 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433589  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  31.74 
 
 
1158 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09280  pyochelin synthetase  34.97 
 
 
1809 aa  479  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3965  amino acid adenylation domain protein  29.88 
 
 
1889 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2602  yersiniabactin non-ribosomal peptide synthetase  34.55 
 
 
2057 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3370  amino acid adenylation  36.52 
 
 
1825 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4997  amino acid adenylation domain-containing protein  36.52 
 
 
1825 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25575  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  34.29 
 
 
1321 aa  459  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5290  amino acid adenylation domain-containing protein  36.18 
 
 
1825 aa  459  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626618  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0673  non-ribosomal peptide synthetase modules  36.05 
 
 
1824 aa  458  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0459649  normal  0.889523 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0628  amino acid adenylation  31.3 
 
 
1837 aa  459  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3470  amino acid adenylation  33.4 
 
 
1167 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3533  amino acid adenylation domain-containing protein  33.4 
 
 
1167 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.639197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3481  amino acid adenylation domain-containing protein  33.5 
 
 
1167 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10847  normal  0.233561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3849  amino acid adenylation domain-containing protein  33.07 
 
 
1149 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239228  normal  0.864277 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3966  amino acid adenylation domain protein  29.81 
 
 
1193 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2098  yersiniabactin synthetase, HMWP2 component  33.95 
 
 
2035 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  33.3 
 
 
2200 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2692  amino acid adenylation domain-containing protein  31.96 
 
 
1152 aa  445  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.131895  normal  0.389847 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  35 
 
 
4268 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  31.59 
 
 
1414 aa  436  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2071  amino acid adenylation domain-containing protein  34.63 
 
 
1326 aa  430  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564639  normal  0.531105 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3032  amino acid adenylation  34.4 
 
 
1884 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4326  amino acid adenylation domain protein  32.44 
 
 
1163 aa  418  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380078  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  33.24 
 
 
1699 aa  416  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0672  non-ribosomal peptide synthetase modules  33.74 
 
 
1469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171178  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0787  non-ribosomal peptide synthase  34.92 
 
 
1489 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0877  non-ribosomal peptide synthase  34.92 
 
 
1501 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.198561  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0874  dihydroaeruginoic acid synthetase  34.55 
 
 
1436 aa  399  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1811  putative siderophore synthetase protein  33.41 
 
 
2006 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159804  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1764  amino acid adenylation domain protein  27.95 
 
 
1497 aa  396  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  28.79 
 
 
1042 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2150  pyochelin synthetase  34.59 
 
 
1511 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1828  pyochelin synthetase  33.81 
 
 
1463 aa  389  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3369  amino acid adenylation  32.55 
 
 
1457 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4998  amino acid adenylation domain-containing protein  32.55 
 
 
1457 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.925482  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5289  amino acid adenylation domain-containing protein  32.81 
 
 
1457 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0334297  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09270  dihydroaeruginoic acid synthetase  33.59 
 
 
1438 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.720802  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0425  amino acid adenylation domain-containing protein  30.45 
 
 
1405 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.939372 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  26.9 
 
 
1069 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  30.67 
 
 
2626 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  29.5 
 
 
3308 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  28.22 
 
 
1093 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  28.95 
 
 
2883 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  27.7 
 
 
4968 aa  365  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  26.83 
 
 
2156 aa  364  6e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  30.32 
 
 
6889 aa  361  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.7 
 
 
8646 aa  361  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  27.15 
 
 
4960 aa  360  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  29.89 
 
 
2883 aa  360  8e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  27.79 
 
 
9175 aa  359  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  30.29 
 
 
4991 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  26.59 
 
 
3695 aa  358  3.9999999999999996e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  31.23 
 
 
1789 aa  357  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  27.08 
 
 
4960 aa  357  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  26.42 
 
 
3374 aa  357  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  29.46 
 
 
2151 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7311  peptide synthetase  29.04 
 
 
2183 aa  355  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  24.91 
 
 
1568 aa  355  2.9999999999999997e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>