More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3045 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  74.46 
 
 		 184 aa  292  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  74.46 
 
 		 184 aa  290  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  74.44 
 
 		 188 aa  283  9e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  72.22 
 
 		 197 aa  275  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  59.67 
 
 		 188 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  59.67 
 
 		 190 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  59.67 
 
 		 187 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  59.44 
 
 		 185 aa  221  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  58.89 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  57.78 
 
 		 188 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  58.33 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  58.89 
 
 		 185 aa  215  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  58.89 
 
 		 185 aa  215  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  58.89 
 
 		 188 aa  214  5.9999999999999996e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  58.33 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  56.11 
 
 		 188 aa  210  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  56.11 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  51.38 
 
 		 187 aa  197  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  61.41 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  54.49 
 
 		 193 aa  190  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  52.84 
 
 		 199 aa  186  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  50.8 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  52.84 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  50.57 
 
 		 193 aa  181  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 		 189 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  48.86 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  49.14 
 
 		 191 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  49.14 
 
 		 191 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  48.86 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  51.69 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 		 194 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  46.59 
 
 		 188 aa  168  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  50.56 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  51.14 
 
 		 189 aa  167  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  47.46 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  51.66 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  44.89 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  48.13 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  48.62 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  49.17 
 
 		 184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  51.27 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  46.28 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  43.68 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  48.65 
 
 		 193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  42.37 
 
 		 183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  48.65 
 
 		 193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  42.37 
 
 		 183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  48.65 
 
 		 193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  48.11 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  54.14 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  55.4 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  48.65 
 
 		 193 aa  158  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  44.75 
 
 		 196 aa  155  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  51.37 
 
 		 307 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  51.37 
 
 		 307 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  45.51 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  47.22 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  47.31 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  49.67 
 
 		 191 aa  154  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  53.9 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  51.72 
 
 		 309 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  44.13 
 
 		 197 aa  154  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  44.13 
 
 		 197 aa  154  9e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  45.99 
 
 		 224 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  44.39 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  44.62 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  47.73 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  46.24 
 
 		 228 aa  151  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  40.11 
 
 		 181 aa  151  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  49.72 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  45.81 
 
 		 196 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  52.25 
 
 		 281 aa  148  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  52.55 
 
 		 293 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  52.55 
 
 		 326 aa  147  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  50.68 
 
 		 190 aa  147  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  50.68 
 
 		 190 aa  147  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  50.68 
 
 		 190 aa  147  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  51.82 
 
 		 298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  47.96 
 
 		 204 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  47.96 
 
 		 204 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  47.96 
 
 		 204 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  45.25 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  45.25 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  50 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  51.69 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  43.58 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  43.58 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  43.58 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 		 201 aa  144  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  50.68 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  42.46 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  51.09 
 
 		 294 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  50.56 
 
 		 184 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  52.6 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  50.36 
 
 		 294 aa  141  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1645  resolvase-like protein  47.17 
 
 		 213 aa  141  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  44.69 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  49.15 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  46.26 
 
 		 309 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>