More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2841 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
250 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  71.71 
 
 
251 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  61.35 
 
 
251 aa  337  9.999999999999999e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  60.56 
 
 
280 aa  335  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  60.56 
 
 
251 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  60.16 
 
 
251 aa  332  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  60.56 
 
 
251 aa  333  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.57 
 
 
251 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0909  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.98 
 
 
251 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.830211  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0224  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.38 
 
 
251 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3396  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.38 
 
 
251 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0217  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.38 
 
 
251 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.950184  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0208  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.38 
 
 
251 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0216  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.38 
 
 
251 aa  275  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00257158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00205  predicted hydroxyacylglutathione hydrolase  55.38 
 
 
251 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3453  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.38 
 
 
251 aa  275  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.837088  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00210  hypothetical protein  55.38 
 
 
251 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.354314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0226  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.98 
 
 
251 aa  274  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0291  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.99 
 
 
251 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0299  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.99 
 
 
251 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0286  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.99 
 
 
251 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0305  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.99 
 
 
251 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435128  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0475  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.4 
 
 
257 aa  262  4e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0284  hydroxyacylglutathione hydrolase  52.59 
 
 
251 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.84 
 
 
259 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.65 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.05 
 
 
258 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.45 
 
 
256 aa  236  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  47.37 
 
 
252 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.02 
 
 
252 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.51 
 
 
258 aa  235  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.9 
 
 
257 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.47 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.08 
 
 
259 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.02 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.87 
 
 
263 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.31 
 
 
256 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.48 
 
 
257 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  43.78 
 
 
263 aa  228  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.48 
 
 
257 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  44.22 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.1 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.8 
 
 
266 aa  224  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.51 
 
 
259 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.8 
 
 
263 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.83 
 
 
259 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.42 
 
 
263 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  46.9 
 
 
259 aa  222  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.42 
 
 
263 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.42 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.08 
 
 
264 aa  218  6e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.64 
 
 
269 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  42.05 
 
 
266 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  42.69 
 
 
265 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.08 
 
 
258 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.09 
 
 
245 aa  215  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.66 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  39.92 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  43.66 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.27 
 
 
259 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.06 
 
 
258 aa  211  7e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.06 
 
 
258 aa  211  9e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.27 
 
 
259 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.57 
 
 
257 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  47.06 
 
 
255 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.06 
 
 
260 aa  208  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1572  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.13 
 
 
266 aa  207  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  43.35 
 
 
284 aa  206  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  43.7 
 
 
267 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.09 
 
 
240 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.48 
 
 
255 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  47.58 
 
 
250 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.54 
 
 
295 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.58 
 
 
250 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.51 
 
 
259 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.73 
 
 
257 aa  204  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.54 
 
 
295 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.68 
 
 
267 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.48 
 
 
267 aa  203  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.19 
 
 
257 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.02 
 
 
258 aa  203  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.27 
 
 
250 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.26 
 
 
254 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.15 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.57 
 
 
279 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  41 
 
 
257 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.77 
 
 
258 aa  198  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2021  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.25 
 
 
258 aa  198  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.64 
 
 
273 aa  197  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.61 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  39.61 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.2 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.92 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.46 
 
 
258 aa  195  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1989  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.02 
 
 
272 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000136825  hitchhiker  0.000132084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3064  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.39 
 
 
242 aa  193  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00018038  normal  0.0339192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.52 
 
 
256 aa  193  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2406  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.13 
 
 
263 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000139632  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2091  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.46 
 
 
271 aa  192  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.700035  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.15 
 
 
255 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>