More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2721 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
207 aa  426  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  75.73 
 
 
207 aa  339  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2993  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  78.26 
 
 
209 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  63.37 
 
 
214 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  63.37 
 
 
214 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  60.98 
 
 
232 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  60.98 
 
 
232 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.49 
 
 
232 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0387  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  58.25 
 
 
211 aa  246  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  55.17 
 
 
208 aa  225  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  58.82 
 
 
208 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  58.82 
 
 
208 aa  223  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.05 
 
 
215 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  51.35 
 
 
217 aa  197  7.999999999999999e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  51.37 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.24 
 
 
212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  52.97 
 
 
203 aa  191  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.24 
 
 
206 aa  191  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.86 
 
 
206 aa  187  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  51.6 
 
 
201 aa  184  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.84 
 
 
202 aa  181  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.89 
 
 
201 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  47.89 
 
 
201 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  46.77 
 
 
203 aa  180  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.61 
 
 
213 aa  180  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  46.56 
 
 
201 aa  178  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.41 
 
 
207 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.07 
 
 
216 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  46.07 
 
 
216 aa  175  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  47.87 
 
 
202 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.28 
 
 
202 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  47.62 
 
 
202 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.46 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.78 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  42.29 
 
 
202 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  47.15 
 
 
203 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  45.27 
 
 
206 aa  170  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  47.15 
 
 
203 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  46.63 
 
 
203 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  47.92 
 
 
202 aa  167  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.57 
 
 
205 aa  167  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  45.55 
 
 
203 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.16 
 
 
201 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.5 
 
 
203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2310  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.68 
 
 
203 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0314932  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.16 
 
 
203 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06238  acyl carrier protein phosphodiesterase  46.41 
 
 
198 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.544939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01081  acyl carrier protein phosphodiesterase  46.41 
 
 
198 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000183186  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.29 
 
 
204 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.21 
 
 
202 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43 
 
 
201 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  43.3 
 
 
182 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  39.41 
 
 
201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  37.62 
 
 
199 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.41 
 
 
201 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  39.41 
 
 
201 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  39.41 
 
 
201 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  39.41 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  39.41 
 
 
201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  38.92 
 
 
201 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.68 
 
 
199 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  39.11 
 
 
201 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  39.11 
 
 
201 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  38.42 
 
 
201 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.97 
 
 
197 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.42 
 
 
198 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.42 
 
 
198 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  35.75 
 
 
201 aa  140  9e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  38.42 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  38.42 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  38.42 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  38.42 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  38.42 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  39.41 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  39.41 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  39.41 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.74 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  39.41 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  39.41 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.81 
 
 
199 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  36.23 
 
 
201 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.31 
 
 
207 aa  139  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  36.95 
 
 
201 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  36.95 
 
 
201 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  36.95 
 
 
201 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  37.93 
 
 
198 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  39.68 
 
 
198 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.68 
 
 
198 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.68 
 
 
198 aa  138  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  35.47 
 
 
201 aa  137  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  36.14 
 
 
201 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  36.59 
 
 
201 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.5 
 
 
199 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.71 
 
 
198 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.5 
 
 
204 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.5 
 
 
204 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.31 
 
 
199 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.15 
 
 
198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3049  azoreductase type 1 family protein  36.45 
 
 
209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.053598  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>