More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2644 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
282 aa  554  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.285231  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  73.05 
 
 
284 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.37 
 
 
291 aa  394  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.86 
 
 
296 aa  387  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.159688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.43 
 
 
275 aa  384  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.68 
 
 
289 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.56 
 
 
257 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.61 
 
 
257 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.14 
 
 
282 aa  360  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.12004  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.48 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6456  ABC transporter permease  72.44 
 
 
258 aa  328  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.9 
 
 
257 aa  298  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214609  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.07 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.01 
 
 
262 aa  211  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4930  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.64 
 
 
267 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.97 
 
 
259 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.58 
 
 
276 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
267 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.5 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.36 
 
 
320 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  38.96 
 
 
275 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.96 
 
 
279 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
255 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
275 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
323 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.226274  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1787  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.05 
 
 
326 aa  148  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.88 
 
 
319 aa  148  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  34.76 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.78 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1386  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  40.58 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.101646 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
324 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
324 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
324 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  34.06 
 
 
286 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
357 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0334046  normal  0.137928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
353 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.19574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
353 aa  142  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  34.31 
 
 
330 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
267 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
279 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.33 
 
 
280 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
412 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0080  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.75 
 
 
318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
253 aa  136  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  34.21 
 
 
272 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
254 aa  135  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  32.91 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 
253 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  33.47 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
254 aa  132  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  33.04 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  32.59 
 
 
283 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
257 aa  132  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
289 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1482  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.24 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  34.85 
 
 
289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
282 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
306 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
285 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.987071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
277 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
281 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
321 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  36.65 
 
 
320 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  32.69 
 
 
275 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  34.65 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.55 
 
 
301 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  31.92 
 
 
275 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  32.31 
 
 
275 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  31.92 
 
 
275 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  31.92 
 
 
275 aa  125  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  30.29 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
293 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.47 
 
 
256 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 
275 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  29.81 
 
 
274 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 
282 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.48 
 
 
259 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>