More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2643 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  100 
 
 
261 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  76.36 
 
 
259 aa  426  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  75.1 
 
 
260 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  76.17 
 
 
259 aa  417  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  74.42 
 
 
259 aa  418  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  73.64 
 
 
259 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  74.42 
 
 
259 aa  407  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  71.71 
 
 
259 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  65.88 
 
 
261 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  66.92 
 
 
264 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  65.38 
 
 
264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  64.94 
 
 
267 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  58.66 
 
 
274 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  54.73 
 
 
278 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  49.8 
 
 
258 aa  278  5e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  54.96 
 
 
303 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  54.96 
 
 
303 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  54.55 
 
 
303 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  49.8 
 
 
254 aa  274  9e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  52.4 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  54.2 
 
 
291 aa  272  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52 
 
 
304 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.6 
 
 
251 aa  270  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  49.41 
 
 
254 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  49.02 
 
 
254 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  54.13 
 
 
253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  49.02 
 
 
254 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  50.85 
 
 
255 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50.41 
 
 
253 aa  264  8.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  50.83 
 
 
307 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  49.22 
 
 
303 aa  262  4e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.42 
 
 
263 aa  262  4e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  50.41 
 
 
306 aa  262  4e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  50.59 
 
 
259 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  52.21 
 
 
267 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.47 
 
 
261 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  53.48 
 
 
254 aa  259  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  50.6 
 
 
264 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  52.84 
 
 
252 aa  260  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.64 
 
 
252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  48.74 
 
 
286 aa  258  6e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  51.59 
 
 
282 aa  258  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  49 
 
 
308 aa  258  7e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  49.39 
 
 
263 aa  258  9e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  51.39 
 
 
257 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  47.93 
 
 
304 aa  257  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  48.74 
 
 
286 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  52.16 
 
 
283 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48 
 
 
253 aa  256  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  49.21 
 
 
257 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  54.59 
 
 
283 aa  254  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.24 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  50.8 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  54.87 
 
 
293 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  48.81 
 
 
258 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.44 
 
 
279 aa  251  7e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.78 
 
 
260 aa  251  7e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  54.42 
 
 
293 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.02 
 
 
297 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  49 
 
 
293 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  47.08 
 
 
267 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  49 
 
 
293 aa  249  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.5 
 
 
260 aa  248  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.28 
 
 
283 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  48.21 
 
 
284 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  54.15 
 
 
261 aa  247  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  47.71 
 
 
271 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  47.37 
 
 
257 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49 
 
 
287 aa  246  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  47.71 
 
 
271 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  48.56 
 
 
267 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.77 
 
 
288 aa  245  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  51.05 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  48.39 
 
 
272 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  48.81 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  55.5 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  51.28 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.94 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  48.29 
 
 
272 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  46.27 
 
 
278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  51.63 
 
 
258 aa  242  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.62 
 
 
271 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 
272 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  47.79 
 
 
289 aa  241  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  46.15 
 
 
276 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 
272 aa  241  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  48.79 
 
 
272 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  46.69 
 
 
315 aa  241  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  46.53 
 
 
251 aa  240  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  46.53 
 
 
251 aa  240  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.94 
 
 
251 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  48.57 
 
 
251 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
251 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  48.59 
 
 
272 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 
251 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
251 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 
260 aa  238  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.52 
 
 
280 aa  238  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 
264 aa  238  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.53 
 
 
287 aa  238  9e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>