More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2421 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  74.18 
 
 
578 aa  867    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  74.35 
 
 
578 aa  872    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  74.35 
 
 
578 aa  872    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  100 
 
 
582 aa  1181    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  74.18 
 
 
578 aa  869    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  75.04 
 
 
578 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  58.65 
 
 
585 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  74.87 
 
 
578 aa  870    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  58.59 
 
 
590 aa  677    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  58.78 
 
 
581 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  56.47 
 
 
580 aa  657    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  56.47 
 
 
580 aa  658    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  74.87 
 
 
578 aa  871    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  74.26 
 
 
579 aa  868    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  79.2 
 
 
580 aa  945    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  57.91 
 
 
578 aa  664    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  74.18 
 
 
578 aa  871    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  74.35 
 
 
578 aa  872    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  58.52 
 
 
580 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  82.35 
 
 
580 aa  971    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  85.17 
 
 
583 aa  1012    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  57.82 
 
 
590 aa  670    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  82.84 
 
 
585 aa  967    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  57.84 
 
 
575 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  75.04 
 
 
578 aa  872    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  74.61 
 
 
578 aa  870    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  74.18 
 
 
578 aa  867    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  79.2 
 
 
580 aa  945    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  74.87 
 
 
578 aa  871    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  58.2 
 
 
582 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  59.37 
 
 
594 aa  682    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  73.83 
 
 
578 aa  865    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  60.21 
 
 
576 aa  671    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  79.9 
 
 
576 aa  943    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  51.99 
 
 
579 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  49.67 
 
 
617 aa  545  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  52.77 
 
 
578 aa  547  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  50.26 
 
 
593 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  49.24 
 
 
599 aa  537  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 
592 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  50.62 
 
 
592 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  52.74 
 
 
593 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  50 
 
 
599 aa  524  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  46.06 
 
 
587 aa  517  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  49.29 
 
 
588 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  43.84 
 
 
589 aa  503  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  45.37 
 
 
583 aa  495  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 
551 aa  495  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  45.75 
 
 
1106 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
541 aa  456  1e-127  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  43.51 
 
 
510 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  39.36 
 
 
651 aa  396  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.86 
 
 
914 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  38.39 
 
 
667 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  38.86 
 
 
904 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  39.43 
 
 
916 aa  359  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  39.67 
 
 
994 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  38.64 
 
 
911 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  38.64 
 
 
911 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  38.64 
 
 
911 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  38.64 
 
 
911 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  38.64 
 
 
911 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  37.7 
 
 
913 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  38.64 
 
 
911 aa  355  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  38.64 
 
 
911 aa  355  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  38.64 
 
 
911 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  38.64 
 
 
911 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  37.52 
 
 
913 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  37.52 
 
 
913 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.33 
 
 
907 aa  353  7e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  37.52 
 
 
913 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  36.98 
 
 
926 aa  350  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  37.75 
 
 
916 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  37.84 
 
 
916 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  37.04 
 
 
912 aa  343  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  37.34 
 
 
917 aa  340  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  37.97 
 
 
1017 aa  339  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  37.48 
 
 
912 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  36.58 
 
 
914 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  36.89 
 
 
928 aa  336  5e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  37.5 
 
 
927 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  35.61 
 
 
918 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  36.33 
 
 
919 aa  336  7.999999999999999e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  37.84 
 
 
936 aa  333  5e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  37.84 
 
 
936 aa  333  6e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  35.17 
 
 
930 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  38.32 
 
 
901 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  38.32 
 
 
901 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  37.41 
 
 
927 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  36.98 
 
 
930 aa  329  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  34.89 
 
 
935 aa  325  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  36.3 
 
 
942 aa  319  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  36.56 
 
 
912 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  34.64 
 
 
915 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  52.87 
 
 
1171 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  49.02 
 
 
512 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  53.74 
 
 
324 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  53.98 
 
 
314 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  52.7 
 
 
308 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  53.46 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>