96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2331 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2331  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 85 aa  173  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2428  protein of unknown function UPF0153  75 
 
 		 84 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1921  protein of unknown function UPF0153  70.24 
 
 		 84 aa  126  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00522326  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3307  hypothetical protein  70.24 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161455  normal  0.0250777 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1650  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0564934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1487  protein of unknown function UPF0153  70.24 
 
 		 84 aa  120  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000107219  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02100  hypothetical protein  70.24 
 
 		 84 aa  120  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02059  hypothetical protein  70.24 
 
 		 84 aa  120  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2318  hypothetical protein  70.24 
 
 		 84 aa  120  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00260934  hitchhiker  0.00124258 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1477  hypothetical protein  70.24 
 
 		 84 aa  120  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000628609  hitchhiker  0.0000139061 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3235  hypothetical protein  67.86 
 
 		 84 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2775  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2696  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1512  hypothetical protein  65.88 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.93354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0791  hypothetical protein  73.61 
 
 		 73 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369058  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2359  protein YeiW  63.1 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000642497  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2765  hypothetical protein  63.1 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.443935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2450  protein YeiW  63.1 
 
 		 84 aa  105  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0381641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2404  hypothetical protein  61.9 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  hitchhiker  0.0000312382 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0049  hypothetical protein  57.14 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0603  hypothetical protein  62.2 
 
 		 98 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0686  hypothetical protein  59.52 
 
 		 94 aa  103  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0043  protein of unknown function UPF0153  59.52 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2476  hypothetical protein  60.98 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0024  hypothetical protein  58.33 
 
 		 111 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0792  hypothetical protein  60.98 
 
 		 105 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0356  hypothetical protein  58.33 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0447585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0856  hypothetical protein  58.54 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0608  protein of unknown function UPF0153  62.65 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00802731  normal  0.548911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0649  protein of unknown function UPF0153  62.65 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572845  normal  0.0906583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3121  protein of unknown function UPF0153  59.76 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4019  hypothetical protein  59.76 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.561383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0071  hypothetical protein  58.33 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3673  protein of unknown function UPF0153  57.83 
 
 		 84 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2091  protein of unknown function UPF0153  59.76 
 
 		 83 aa  97.1  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0939789  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2609  hypothetical protein  57.65 
 
 		 88 aa  95.9  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0885  hypothetical protein  58.54 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0436  hypothetical protein  58.54 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.452885  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0915  hypothetical protein  58.54 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0272  hypothetical protein  58.33 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3788  hypothetical protein  55.42 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000190416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2875  hypothetical protein  55.95 
 
 		 88 aa  94.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2041  hypothetical protein  53.66 
 
 		 83 aa  92.8  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3094  hypothetical protein  57.32 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3059  hypothetical protein  57.32 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2170  hypothetical protein  57.32 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.298759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0740  hypothetical protein  57.32 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2040  hypothetical protein  57.32 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.321846  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2573  hypothetical protein  57.32 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0378  protein of unknown function UPF0153  54.76 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2707  hypothetical protein  52.38 
 
 		 99 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3121  proteinase inhibitor  56.1 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0755  hypothetical protein  53.57 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2510  hypothetical protein  51.81 
 
 		 83 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0872529  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1510  hypothetical protein  56.1 
 
 		 109 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0353  protein of unknown function UPF0153  53.57 
 
 		 85 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0115675  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3747  protein of unknown function UPF0153  53.57 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44090  putative Fe-S-cluster oxidoreductase  51.81 
 
 		 84 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3811  hypothetical protein  53.66 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.214494  normal  0.3125 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29830  hypothetical protein  51.22 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3749  Fe-S-cluster domain-containing protein  51.9 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4110  hypothetical protein  51.81 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2988  hypothetical protein  52.38 
 
 		 87 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000376291  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0038  hypothetical protein  49.4 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304383  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1932  hypothetical protein  48.81 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3703  hypothetical protein  49.4 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2192  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4337  hypothetical protein  48.19 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0038  hypothetical protein  48.19 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4195  hypothetical protein  46.99 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0876839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0040  hypothetical protein  48.19 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.140935  hitchhiker  0.000251454 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4475  hypothetical protein  46.99 
 
 		 83 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000150782  decreased coverage  0.00000000228641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3767  hypothetical protein  48.19 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1658  hypothetical protein  46.99 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0575  hypothetical protein  49.4 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000579653  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0035  hypothetical protein  46.99 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3519  hypothetical protein  46.99 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0042  protein of unknown function UPF0153  48.19 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000233524 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0046  hypothetical protein  48.19 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000739222 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2002  hypothetical protein  48.81 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.786219  normal  0.232569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3912  hypothetical protein  51.19 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0044  hypothetical protein  48.19 
 
 		 83 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4222  hypothetical protein  48.19 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0055  hypothetical protein  46.99 
 
 		 83 aa  77  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0585048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4193  hypothetical protein  59.68 
 
 		 62 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000765496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4025  hypothetical protein  46.34 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90654  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4882  hypothetical protein  44.58 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1006  hypothetical protein  43.9 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0803  hypothetical protein  53.23 
 
 		 70 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03942  proteinase inhibitor  51.61 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0699  hypothetical protein  52.46 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00386805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0042  hypothetical protein  37.7 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0871438  unclonable  0.0000116494 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002895  hypothetical protein  35 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0219  protein of unknown function UPF0153  43.64 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.162124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2777  hypothetical protein  42.62 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0388254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28820  uncharacterized low-complexity protein  46.67 
 
 		 298 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.190064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>